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R相关性分析和相关性热图相关性分析 相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析，从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性分析旨在研究两个或两个以上随机变量之间相互依存关系的方向和密切程...
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pheatmap|暴雨暂歇，“热图”来袭！！！
热图可以聚合大量的数据，并可以用一种渐进色来优雅地表现，可以很直观地展现数据的疏密程度或频率高低。 本文利用R语言pheatmap包从头开始绘制各种漂亮的热图。参数像积木，拼...
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CubicHeatMap - 重磅推出 - 魔方热图 - 伪三维Emmm, 今天的主图， 写在前面 博士毕业论文中，使用的样品包括： 不同的类型 / 或者说不同的组织 不同的时间 / 或者说时间序列所以，是一个多X多的设计。对于这类实验设...
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R语言学习笔记之热图绘制TaoYan 简介 本文将绘制静态与交互式热图，需要使用到以下R包和函数：heatmap():用于绘制简单热图的函数heatmap.2():绘制增强热图的函数d3heatma...
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2019第23周：评《R语言数据可视化之美：专业图表绘制指南》"Beautiful Visualization with R" provides a comprehensive introduction to the many type...
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Volcano plot | 别再问我这为什么是火山图
火山图是散点图的一种，它将统计测试中的统计显著性量度（如p value）和变化幅度相结合，从而能够帮助快速直观地识别那些变化幅度较大且具有统计学意义的数据点（基因等）。常应用...
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10xGenomics单细胞转录seurat包提取表达量画小提琴图10xGenomics单细胞转录seurat包提取表达量画小提琴图 需求提取表达画小提琴图对噪音处理 需求 其实seurat包已经有画小提琴图的函数，VlnPlot，参数也较...
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单细胞之Seurat包实战单细胞之Seurat包实战 我们演示的数据集是E-MTAB-7704,可以从github中下载。 1. 特征描述 2. PCA主成分分析 PCA分析 绘制每个PCA成分的相关...
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pathview包的使用心得推荐一个网址，立志于学习此包的伙伴。 可视化kegg通路-pathview包，这个网页的下边还有关于这个包的使用说明书，很全，帮助你更好深入学习。 我没有使用这个包是因为找到...
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KEGG分析工具：pathview基本操作什么是KEGG KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是系统分析基因功能、基因组信息数据库，它有助于研究者把基因及表达信息...
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KEGG Pathway通路结果绘制气泡图
参考CSDN博客ntuYision：使用R语言ggplot2包绘制pathway富集分析气泡图（Bubble图）:数据结构及代码 getwd() setwd("D:/Desk...
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48个实用的生信在线工具在线工具一般具有“功能强大、操作简单、无需安装、用完就走”的特点，轻松实现“用别人的服务器分析自己的数据”。 基因结构绘制 1.Exon-Intron Graphic Mak...
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用ggplot2画代谢集富集分析（MSEA）图MSEA 什么是MSEA MSEA，Metabolite Set Enrichment Analysis，代谢集富集分析，是代谢组数据分析方法的一种。MSEA是基因集富集分析...
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STRING:蛋白质相互作用(PPI网络)数据库简介
欢迎关注”生信修炼手册”! 研究蛋白之间的相互作用网络，有助于挖掘核心的调控基因，目前已经有很多的蛋白质相互作用的数据库，而string绝对是其中覆盖的物种最多，相互作用信息...
