果蝇饲养员的生信笔记

相关性分析 相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析，从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性分析旨在研究两个或两个以上随机变量之间相互依存关系的方向和密切程...

生信补给站

热图可以聚合大量的数据，并可以用一种渐进色来优雅地表现，可以很直观地展现数据的疏密程度或频率高低。 本文利用R语言pheatmap包从头开始绘制各种漂亮的热图。参数像积木，拼...

生信石头

Emmm, 今天的主图， 写在前面 博士毕业论文中，使用的样品包括： 不同的类型 / 或者说不同的组织 不同的时间 / 或者说时间序列所以，是一个多X多的设计。对于这类实验设...

taoyan

TaoYan 简介 本文将绘制静态与交互式热图，需要使用到以下R包和函数：heatmap():用于绘制简单热图的函数heatmap.2():绘制增强热图的函数d3heatma...

周运来就是我

"Beautiful Visualization with R" provides a comprehensive introduction to the many type...

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火山图是散点图的一种，它将统计测试中的统计显著性量度（如p value）和变化幅度相结合，从而能够帮助快速直观地识别那些变化幅度较大且具有统计学意义的数据点（基因等）。常应用...

尧小飞

10xGenomics单细胞转录seurat包提取表达量画小提琴图 需求提取表达画小提琴图对噪音处理 需求 其实seurat包已经有画小提琴图的函数，VlnPlot，参数也较...

多啦A梦詹

单细胞之Seurat包实战 我们演示的数据集是E-MTAB-7704,可以从github中下载。 1. 特征描述 2. PCA主成分分析 PCA分析 绘制每个PCA成分的相关...

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推荐一个网址，立志于学习此包的伙伴。 可视化kegg通路-pathview包，这个网页的下边还有关于这个包的使用说明书，很全，帮助你更好深入学习。 我没有使用这个包是因为找到...