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网上可以搜到大量的R语言singleR的代码和教程,但python版的就比较少啦,恭喜你找到了我。 1.文件读取 输入的数据是10X标准的三个文件 用read_10x_mtx...
小编发现我们经常使用的TCGA数据库,大概在2022年4月初进行了更新。以前RNAseq数据使用的是Htseq-counts,新版本中使用了STAR-counts。在上一期中...
CNVnator服务器:centos7 CNVnator 安装过程GitHub - abyzovlab/CNVnator: a tool for CNV discovery ...
copynumber 是一个功能强大拷贝数分析工具,这里仅限于自己用的的部分功能,看到可用hg38版本,就尝试运行了一下,识别CNV break points。
大家好,我是生信技能树线下培训和线上直播课团队的全职讲师,就是在公众号发布过的学徒作业、学员反馈和感言里常被cue到的小洁老师本师。 刚刚过去的2020年,没什么记忆,除了长...
前言 我是在y蜀黍的书里(搜索clusterProfiler book 即可找到)看到了一个叫msigdbr的包,就是把MsigDB的那些基因集合都R语言化了。那么以后想做G...
我是谁 几年前曾在中科院上海生命科学研究院生化细胞所读研,两年半后申请了退学,要说为什么,我只能羞愧地说:因为无知。 几经辗转,最后到诺禾海外部做了一名销售,光阴似箭,快两年...