IP属地：安徽
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snpEFF 使用小tip安装： 构建注释库 (1)由于课题中加了点变动，注释信息有些改变，需要自己创建库 首先 在snpEFF 文件夹下创建data 文件夹 (2)随后...
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plink 用法
最近在学习plink软件的用法：用到什么就查一些东西，零零碎碎，整理一下，当做备份。 plink --file data --recodeAD ...
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机器学习分类方法小结
最近要开始做一个分类器，因此，参考了几篇文献，并在自己的数据上进行了测试，可用。1. 数据当然了，需要准备两个数据集合，一个数据集合作为训练集合...
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copynumber
copynumber 是一个功能强大拷贝数分析工具，这里仅限于自己用的的部分功能，看到可用hg38版本，就尝试运行了一下，识别CNV break...
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pip install 镜像
最近安装tensorflow 总是很慢，找了几个镜像，自己备份一下，在linux 服务器上安装时，记得用https pip3 install -...
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breakdancer-CNV
在安装时，使用conda 进行安装， conda install -y breakdancer 安装完，运行 bin/bam2cfg.pl 报错...
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qsub 免密码投递任务cd ~ 为个人home 目录目录下很多文件： 记得改目录权限不然，会出现问题chmod 700 -R .sshcd ~/.ssh/cat i...
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logistic 模型构建
使用的是R包glmnet 函数，有些时候由于方法不收敛可以增加迭代次数，使得模型收敛。 log_res<-glm(pheno~PRS,famil...