使用的是R包glmnet 函数，有些时候由于方法不收敛可以增加迭代次数，使得模型收敛。 log_res<-glm(pheno~PRS,family=binomial(link...
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logistic 模型构建
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pip install 镜像
最近安装tensorflow 总是很慢，找了几个镜像，自己备份一下，在linux 服务器上安装时，记得用https pip3 install --user -i http...
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breakdancer-CNV
在安装时，使用conda 进行安装， conda install -y breakdancer 安装完，运行 bin/bam2cfg.pl 报错 是没有安装这个Statist...
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qsub 免密码投递任务cd ~ 为个人home 目录目录下很多文件： 记得改目录权限不然，会出现问题chmod 700 -R .sshcd ~/.ssh/cat id_rsa.pub >> au...
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机器学习分类方法小结
最近要开始做一个分类器，因此，参考了几篇文献，并在自己的数据上进行了测试，可用。1. 数据当然了，需要准备两个数据集合，一个数据集合作为训练集合（train_dat），另一个...
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免疫基因组指标的计算（6个）1.Mutation load 肿瘤突变负荷 2.新抗原负荷（Neoantigen load） 配对样本的全外的.bam数据，第一步通过POLYSOLVER tool工具对每...
