1. 官网查看版本,因为7.2.0兼容低通量的数据,所以决定安装7.2.0 2. 按照个人习惯,网上搜安装帖子,出现两个问题 1)wget 下载报错,可能是因为链接权限的...

1. 官网查看版本,因为7.2.0兼容低通量的数据,所以决定安装7.2.0 2. 按照个人习惯,网上搜安装帖子,出现两个问题 1)wget 下载报错,可能是因为链接权限的...
#保存文件 write.table(final_gene$Var1,paste0(pro,"_gene_v2.txt",sep = ",",quote = F,row.nam...
作为生命科学的从事者,不论是老师或者学生都应该用过NCBI((National Center for Biotechnology Information Search d...
按照官网教程安装CeleScope: 出现各种 Cython.Compiler.Errors.CompileError: 以及 note: This error origin...
一、ScaleData()简介 单细胞基因表达counts矩阵数据经过NormalizeData()归一化处理后,还需要进行scale标准化。ScaleData()[http...
本次笔记内容:fill =的位置: ggplot(aes(fill = )) & geom_boxplot(fill = ) & geom_boxplot(aes(fill ...
@(Dayueban)[靶向|非靶向|代谢组学数据分析] 导读 如今组学数据的产出量日益庞大。代谢组学数据也是如此,随着科技的创新和技术的变革,允许科研工作者们通过大样本数据...
由于太久没有分析过bulk数据了,前几天突然被要求分析一个文章的数据时有点乱了手脚,所以在这里想总结一下关于芯片数据与seq数据的差异分析流程。 假如你是小白,也刚刚了解NG...
按照字母排序,谁排在后面谁是分子,排在前面为分母 GEO芯片分析中的大坑,差异基因完全相反! GEO的芯片分析,可以看一下这一篇。最有诚意的GEO数据库教程 GEO的芯片分析...
轨迹分析系列: 单细胞之轨迹分析-1:RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析(Pseudot...
关于 pheatmap 作图时的报错 作图时,颜色向量没有和注释数据框里的向量作匹配(偷懒),所以出现以下报错,解决办法:指定每个颜色对应的名称。 aa <- unique(...
在诸如:ChIP-seq、ATAC-seq、MeRIP-seq(m6A)、Cut&Tag中我们常常听到一个词Call Peak。Call Peak究竟是什么东西,得到的结果又...
1.R程序并行运算和调整R内部允许的对象大小的限制 默认是500 * 1024 ^ 2 = 500 Mb future在seurat的具体应用详见:https://satij...
1. Seurat对象查看当前的Assay 在进行了SCTransform操作后,矩阵默认会变成SCT矩阵,如果不加设置,后续的PCA等操作都是基于SCT矩阵。修改Defau...
ggpubr: 'ggplot2' Based Publication Ready Plots 一款基于ggplot2的可视化包ggpubr,能够一行命令绘制出符合出版物要求...