问题： 有时候拿到的样本的UMAP图形如下：灰色的细胞点多于紫色的细胞点，显示的结果都是都一个样本的细胞 针对以上问题DimPlot有个参数：shuffle可以解决这个问题 ...
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DimPlot散点图解决颜色叠加问题 -
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test_meta.txt test_counts.txt 这两个文件可以指定全路径
CellPhoneDB
背景介绍 CellPhoneDB是公开提供的精选受体，配体及其相互作用的存储库。配体和受体均包含亚基结构，可准确代表异聚复合物。这是至关重要的，因为细胞之间的通信依赖于多亚基...
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一个R包玩转单细胞免疫组库分析，还能与Seurat无缝对接
在介绍clonotypr(https://github.com/mattfemia/clonotypr)包之前，我们需要先去解决几个问题： （1）为什么要进行单细胞免疫组库的...
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利用ggplot2绘制SCI样式的UMAP图Seurat包展示出来的umap/tsne图都是带有横纵坐标，基于Seurat包可能比较难调整图片的样式，只能借助AI或者PS处理图片。这次借助ggplot2进行可视化，对于...
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单细胞SRR数据拆分
10X单细胞转录组测序数据的 SRA转fastq fastq-dump SRA转fastq 参考链接：10X单细胞转录组测序数据的 SRA转fastq踩坑那些事[https:...
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ggplot2 金字塔图形（双向柱状图）这篇文章主要是分享一下金字塔图形的绘制方法，其来源是文章中的图E，如下： 看了一下，可以通过ggplot2来实现，数据来自于自己试验的数据（该数据也是两个样本整合的数据，计算...
