前言 我是在y蜀黍的书里(搜索clusterProfiler book 即可找到)看到了一个叫msigdbr的包，就是把MsigDB的那些基因集合都R语言化了。那么以后想做G...
IP属地：山东
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GSEA和GSVA，再也不用去下载gmt文件咯 -
aglient芯片原始数据处理本文讲的是aglient芯片原始数据的处理，参考资料是limma 的userguide文档。GEO数据库下载的表达矩阵不符合预期，比如是空的，或者是有负值的，那我们就处理一下...
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报错处理——object ‘CsparseMatrix_validate‘ not found
在使用Seurat进行单细胞分析时，使用FindNeighbors函数功能时，出现下面的报错 这是Matrix这个包有问题，需要更新Rtools，并重新装载Matrix这个包...
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R报错-gather & spread 函数，有新版替代函数做一个练习题，以为很简单，但是却碰到问题 1.将iris数据框的前4列gather，然后还原 还原 错误: Each row of output must be identi...
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听说你想要TCGA的miRNA表达数据
以前都是直接拿前体数据去处理，今天偶然在群里看到，想用isform做一下试试。我非常喜欢gdc-client这个官方下载工具,它的数据以样本的方式组织，优点是可以随便组和，缺...
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R爬虫必备基础——CSS+SelectorGadget
CSS的简单介绍 CSS，全称叫作Cascading Style Sheets，即层叠样式表。“层叠”是指当在HTML中引用了数个样式文件，并且样式发生冲突时，浏览器能依据层...
