seqyuan

作者：ahworld链接：空转分析代码备忘录：seurat可视化代码雕琢[https://mp.weixin.qq.com/s/nzKN6-AYiZZflbPHreRZMQ]...

小贝学生信

1、基础知识 （1）基本概念 富集分析(enrichment analysis)简单来说就是将成百上千个基因、蛋白或者其他分子分到不同的类中，以减少分析的复杂度。比如之前差异...

纷纷不可诉

1.背景 单细胞数据分析在进行完细胞自聚类或者细胞类型注释后，一般需要对查到的差异基因可视化，用来显示基因和细胞群的相关性，进行后续分析。当然Seurat和scanpy本身可...

单细胞空间交响乐

hello，大家好，今天我们来分享一下最新常用的聚类算法----leiden，其实大家在看Seurat的函数FindClusters可能会观察到，其中有一个参数algorit...

RedStones

1. 文献怎么用 monocle2 ? (1) ex1 作者处理2种细胞使用的策略还不一样！ 中性粒细胞 neutrophil 是先subset出来，去除污染细胞，然后Seu...

胡童远

导读 使用 HUMAnN2（The HMP Unified Metabolic Analysis Network 2）进行宏基因组学分析。 HUMAnN2 在宏基因组研究中非...

胡童远

导读 第一次做宏基因组还是在2018年，现在2021很多软件数据库大更新，这里搭建目前比较受认可的流程，即用Kneaddata（trimmomatic bowtie2） kr...

Hayley笔记

单细胞富集分析系列： 单细胞之富集分析-1：单细胞GSEA分析流程[https://www.jianshu.com/p/00f069cb239c] 单细胞之富集分析-2：批量...