欢迎关注，同名公主号，BBio 一般来说，无论是人工还是软件自动注释，都要先进行无监督的聚类，然后以 cluster为单位进行注释。文章通过比较32款工具的准确性、运行时间等...
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文献速递||综述-单细胞自动化注释32款工具的比较及SingleR简介 -
单细胞转录组数据 细胞注释指南
细胞注释是单细胞转录组分析的重要环节，来自加拿大的研究人员在《Nature protocols》发表细胞注释教程综述，介绍了单细胞转录组数据分析中细胞注释的一般工作流程，涵盖...
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感谢你的分享，帮我解决了同一个问题
DatabaseImmuneCellExpressionData()下载异常问题解决
DatabaseImmuneCellExpressionData数据集时，出现同一个错误： > ref <- DatabaseImmuneCellExpressionD...
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DatabaseImmuneCellExpressionData()下载异常问题解决
DatabaseImmuneCellExpressionData数据集时，出现同一个错误： > ref <- DatabaseImmuneCellExpressionD...
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利用r语言实现DNA双序列全局比对（Needleman-wunsch算法)序列比对实验报告 一．实验内容 1.利用序列比对线上工具做序列比较2.Blast线上工具使用3.使用r语言实现Needleman-Wunsch算法 二．实验目的 1.掌握序列...
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R 缺失值处理处理方法：常规方法 由mape（Mean absolute percentage error，平均绝对百分比误差）可知，以上的效果都不咋的，随机填补的效果竟然处于第一等（和平...
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sva_combat校正批次效应安装包 使用内置数据 使用Hierarchical clustering的方法去看一下聚类的情况 校正批次效应,model可以有也可以没有，如果有，也就是告诉combat，有...
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如何用R语言优雅地写作（一）R Markdown:Elegant, flexible and fast dynamic report generation with R 如果你已经厌倦 Word 或 P...
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R语言进阶路上||遇见apply函数家族在使用R语言进行数据分析时，我们发现一个重要的部分就是对数据的处理和转化。真正的统计建模以及数据可视化均有相应的函数来完成——需要我们把数据整理（tidy）成所用函数需要的格...
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R语言：统计多个数据框中分类变量各值的频数导读 查看文件、获取ID读取数据表读取数据表 一、查看文件、获取ID 关键参数：list.files(pattern="条件") # 根据条件获取文件名strsplit(向...
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【文献】单细胞 T细胞受体(TCR)测序：技术与挑战Single Cell T Cell Receptor Sequencing: Techniques and Future Challenges单细胞T细胞受体测序：技术与挑...
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Seurat的单细胞免疫组库分析来了！
使用Seurat进行单细胞VDJ免疫分析 NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP...
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Mac上使用FFmpeg想要在Mac上下载m3u8格式的视频 可以使用VLC播放器观看存储，不过有一定的局限性，转换视频会有马赛克 1.打开终端执行 首先安装FFmpeg 需要Homebrew[ht...
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桑基图绘制（sankey diagram）R常用的方法有：ggalluvial[https://www.jianshu.com/p/148ca7c7af59]sankeyNetwork[https://www.jia...
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免疫组库分析软件MiXCR的安装和使用安装 conda安装 普通安装 在Mac OS X上使用Homebrew或者在Linux系统上使用linuxbrew安装 将已经安装的MiXCR更新到最新版本 手动安装 在r...
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Mac上如何读写移动硬盘？三款NTFS读写软件分享给大家NTFS是微软开发的，在目前使用的大部分电脑操作系统上，都支持此类格式的读写。然而Mac电脑上无法通过正规途径进行NTFS格式硬盘的写入，怎么解决这个难题呢？三款NTFS读写...
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单细胞转录组测序分析--初探Seurat单细胞转录组测序--闲言碎语 时代发展的步伐总是毫不留情的将你甩在身后，连车尾灯都看不见。当你还在沉迷于普通转录组数据挖掘时，已经有人悄悄的搞上单细胞了。单细胞转录组测序，顾...
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单细胞测序（scRNA-seq）通关||数据处理必知必会单细胞转录组数据分析系列教程 sc-RAN-seq 数据分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jians...
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macOS Catalina开启读取NTFS功能开启Mac自带的读取NTFS功能 有的同学用Paragon，有的同学用Tuxera，我就偏偏不用（没钱但又理直气壮）好像是因为NTFS是微软的技术不让用，所以Mac默认关闭了...
