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参考链接 如何对基因组进行注释[https://www.jianshu.com/p/931e9821c45a] 从头预测，同源注释和转录组整合都会得到一个预测结果，相当于收集...

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同源预测(homology prediction)利用近缘物种已知基因进行序列比对，找到同源序列。然后在同源序列的基础上，根据基因信号如剪切信号、基因起始和终止密码子对基因结...

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前言 最近的推文将是一个大系列，目录就不放了，可能会有点多，主要涉及了基因注释，比较基因组学分析，基因家族分析等，大家看我博客的顺序就行。 基因注释参考链接[https://...

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ONT全长转录组测序是指基于牛津纳米孔公司（Oxford Nanopore Technologies，ONT）三代测序平台进行的全长转录组测序。利用三代测序平台长度长 （lo...

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作者： 童 蒙编辑：amethyst 可变剪接作为转录后修饰的重要环节，对细胞的活性和疾病的发生发展都有广泛的作用。尽管目前软件很多，但是软件间的比较却比较少。作者系统地...

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作者：Arno审稿：童蒙编辑：angelica 前面我们介绍了PacBio三代全长转录组测序相关的全长转录本鉴定、全长转录本比对、全长转录本结构分析上篇。 今天我们继续介绍包...

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我也认为长读长测序是 RNA 测序的未来！随着价格的降低和碱基质量的提升，传统的二代RNA-seq会被逐渐取代。 很多物种的转录本非常多样和复杂，绝大多数真核生物基因不符合“...

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前言：进行RNA-seq入门实战首先需要有一定的linux与R基础，推荐跟着B站生信技能树-jimmy老师学习打牢基础：【生信技能树】生信人应该这样学linux(更新至第14...

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最近打算做可变剪切分析，查了做分析的软件发现rMATS这个软件被很多人推荐，于是打算就用它来分析吧。本着方便易懂的原则，搜索了“rMATS安装教程”。发现都讲的不是很明白而且...

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1. 创建小环境 rMATS是常用的选择性剪切（alternative splicing）分析软件。目前最新版是rMATS 4.1.2，已经可以通过conda安装，步骤如下：...

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作者：椰子糖审稿：童蒙编辑：amethyst 可变剪切能够产生多种类型的mRNA，因此一个基因就可以产生多种不同的蛋白。这个过程极大的增加了mRNA和蛋白质的多样性。可变剪切...

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rMATS是常用的选择性剪切（alternative splicing）分析软件。目前最新版是rMATS 4.1.2，已经可以通过conda安装，步骤如下：第一步创建小环境r...

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受人之托，所以又跑到另外一个领域去了，中文的资料还不是很全，所以还是自己动手吧 可变剪切工具大全 HussainAther/awesome-alternative-splic...

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rmats是一款比较好的分析可变剪切的分析软件，将rmats分析的结果，利用rmats2sashimiplot绘画出的图也是比较漂亮的， 可变剪切事件： 可变剪切事件可以分为...

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miso是一个可变剪接可视化软件，对mRNA水平或者外显子水平的可变进行可视化； 官网 https://miso.readthedocs.io/en/fastmiso/#vi...

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期刊：Molecular Ecology Resources 影响因子：7.093 文章题目：Single-molecule long-read sequencing rev...