IP属地：上海
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单细胞软件学习--泛癌的TME细胞类型分类工具scATOMIC（single cell annotation of tumour microenvironments in pan-cancer ...一、背景简述 肿瘤微环境（Tumor micro-environment, TME）是指肿瘤细胞周围异于正常内环境的微环境，具有缺氧、慢性炎症及...
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conda 环境中默认加载libPath情况一般在conda创建的环境中，安装R软件是安装在 miniconda3/env/your_env/lib/R/library 目录，但是后期在安...
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个人电脑上SRR数据下载第一种，在EBI 查找，https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home[https://www.ebi.ac.uk...
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excel操作
批量取消隐藏的sheetAlt+F11，单击插入，模块，运行 Sub ShowSheets()For Each Sheet In SheetsS...
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对SNP的VCF文件质控筛选对SNP的VCF文件质控筛选 1.vcfR简介 vcfR is a package intended to help visualize, ma...
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定量分析htseq
HTSeq使用注意事项 简述： HTSeq是转录组定量分析的软件，其输入文件必须有bam（sorted）和GTF文件。 一般情况下HTSeq得到...
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融合基因分析结果可视化融合基因，是指将两个或多个基因的编码区首尾相连,置于同一套调控序列(包括启动子、增强子、核糖体结合序列、终止子等)控制之下,构成的嵌合基因，融合...
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MISO 可视化学习miso是一个可变剪接可视化软件，对mRNA水平或者外显子水平的可变进行可视化； 官网 https://miso.readthedocs.io/...
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hisat2比对
基因组比对软件常用bwa，转录组比对软件常用bowtie2、hisat2等，其中有参考基因组的常用hisat2，没有参考基因组的常用bowtie...