IP属地：云南
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【第 0 章 绪论】作物育种学总结笔记
作物生产改良途径：作物遗传改良、作物生长条件改善 第一节 作物进化与遗传改良 一、作物品种的概念 1. 品种（variety/cultivar）：人类在一定生态条件和经济条件...
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2022-09-05 | 关于QTL，GWAS之间的关系以及其衍生概念
1.QTL:Quantitative Trait Loci，概念自己查，说的是基因型和snp位点的关系，多用于单一种群，遗传背景简单的，避免受population struc...
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共线性分析 | MCscan (Python version JCVI 包)共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件。今天主要测试的是Python版McScan（jcvi工具包），这个包很强大，是从MCScanx升级而来的基因组共线性分析软件。 ...
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跟着Briefings in Bioinformatics学数据分析：植物线粒体基因组组装流程GSAT初步尝试论文 Master graph: an essential integrated assembly model for the plant mitogenome based ...
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三代组装软件——Flye
转自：https://www.jianshu.com/p/efbd1998db69[https://www.jianshu.com/p/efbd1998db69] 一、介绍 ...
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群体遗传分析之重测序
从公司测序返回的数据一定要搞清楚是clean还是raw data，不然就会想我一样从头再来！ 如果是raw，可以使用fastp 进行过滤，软件使用很方便，Linux可以直接用...
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PSMC软件分析群体历史有效群体大小步骤
https://blog.csdn.net/zaprily/article/details/108764219[https://blog.csdn.net/zaprily/a...
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群体遗传学与重测序分析分子层面对生物的研究，在个体水平上主要是看单个基因的变化以及全转录本的变化（RNA-seq）；在对个体的研究的基础上，开始了群体水平的研究。如果说常规的遗传学主要的研究对象是...
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生物信息编程
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群体适应性分析——选择信号●选择信号：生物在自然选择或人工选择过程中，由于选择作用在基因组上留下的遗传多态性降低、连锁不平衡等选择印记。●选择性清除（selective sweep）：受选择基因座位的...
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芜湖，我又回来了，和坐过山车一样
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动物驯化及群体历史研究●与驯化相关的研究热点主要集中在：家养动物何时何地被驯化？驯化途径是什么？驯化表型是什么？与驯化表型相关的基因有哪些？家养动物驯化地点大致主要集中在三个地方：近东地区、中国中...
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遗传统计|MSMC推断群体历史动态Multiple Sequentially Markovian Coalescent (MSMC)是一种利用马尔可夫模型推断群体动态历史和群体结构的算法。能够通过输入基因组序...
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中科院遗传发育所在读博士，研究水稻。关注植物免疫和群体遗传进化，经常摸鱼学生信。同名CSDN分享代码，欢迎围观~
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种群动态历史评估方法之 SFS（Site/Allele Frequency Spectrum）SFS的基本理解、介绍的一篇文章：https://theg-cat.com/tag/joint-sfs/[https://theg-cat.com/tag/joint-sfs...
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