需要看下Nip和9311的基因匹配的有多少，思来想去，blast还是有点缺陷的，可能匹配到其他染色i他，需要用gff来帮助定一下位。所以，用基因的共线性分析看起来更合适一点。...
发简信
IP属地：河北
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2024-11-07 籼稻粳稻基因组共线性分析-jcvi -
@顾大师 先配置好该配置的所有的，然后再装软件试试？
好久了，我也忘记了2019-08-01 SMRTlink7.0 安装超不顺利。。。
可参考安装流程：https://vcru.wisc.edu/simonlab/bioinformatics/programs/install/smrt.htm遇到问题1 查找...
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2024-06-03 AI拆解高通量数据的批次效应去除pycombat包
1. 介绍 这个代码实现了一个名为Combat的类，该类用于数据的批次效应校正。Combat (ComBat) 是一种广泛应用于基因表达数据和其他高通量数据的批次效应校正方法...
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这种渣渣还不挂出来实名鞭尸，妹子你真是发自心底的善良啊
关于简书笔记的一些想法
在简书上做笔记已经快两年了，在记录笔记的过程中自己学到了很多，同时也想把自己看到的知识分享给有同样需要的人。然而在这个过程中，也让我见识到了各式各样的人。有很多同学发简信和我...
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几种标准化方法的学习笔记不管在RNA-seq还是ChIP-seq分析中，都涉及到一个概念，就是标准化。作为一个刚入门的小白，总是听王院长和其他熟悉生信分析的同学们强调标准化的重要性。 为什么说它重要...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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利用三代转录本升级基因组注释（gff3）因为课题需要，我们在前期组装了一个基因组并进行了注释，但是存在两个问题，一个是没有考虑可变剪切，另一个是注释的基因并不准确，三代转录组的广泛普及对于基因研究提供了很大的便利，...
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三代组装注释
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真的要等伤口拆线后，才能洗澡么？外科手术，几乎都会有缝（钉）合的伤口。手术后，患者最担心的也就是伤口感染。 实际上，外科医生比患者更害怕这个，所以他们才会穷尽所能的在各方面严格要求，以期避免切口感染。 比如...
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随笔 | 近日二三乐事初建办公环境 去年寒假，基本每个星期都在贵广飞来飞去。到贵阳时，除了带娃，还是要搞一些工作。一直用笔记本远程办公，多少还是不太方便，尤其是笔记本用着用着会发烫，似乎有点对不起...
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「TBtools奖学金」正式设立！给“沉默”的人~今天想想，简单与大伙通告一下。其中故事，有时间再聊聊。事情简单。首先是，每个月都会喊大伙交稿费，一般每人 2 元，保守估计，每个月稿费总计在 12,000 元。大体如下， 详...
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单细胞smart-seq2建库原理应用单细胞测序技术研究科学问题越来越普遍，当下应用最火热的是10X Genomics公司的解决方案，但是在某些特殊或者少量细胞样本的单细胞转录组研究中，Smart-seq2技...
