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  • PASA(2.4.1)使用记录

    文章仅是记录自己的学习使用,有错误请指出,我立刻改正! 官方说明:https://github.com/PASApipeline/PASApipeline/wiki[http...

  • 基于PASA进行基因预测

    PASA[http://pasa.sourceforge.net/], acronym for Program to Assemble** S**pliced Alignme...

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    非模式生物重复序列注释 RepeatModeler2+RepeatMasker4

    首先安装RepeatModeler2,RepeatMasker4建议直接去官网下载,解压安装。同时安装其他包。安装流程这里不详细介绍了,网上有很多。 假设现在已经安装完毕,并...

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    基因组重复序列检测:RepeatMasker的安装及使用

    RepeatMasker是重复序列检测的常用工具,通过与参考数据库的相似性比对来准确识别或屏蔽基因组中的重复序列,属于同源预测注释的方式。下文除了RepeatMasker的使...

  • 如何登录web界面啊

    2019-08-01 SMRTlink7.0 安装超不顺利。。。

    可参考安装流程:https://vcru.wisc.edu/simonlab/bioinformatics/programs/install/smrt.htm遇到问题1 查找...

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    De novo组装#03 | 基因组拼接(flye, wtdbg2, mecat2, canu)

    写在前面 前面两篇文章De novo组装#01 | 测序数据质控(fasqc+fastp)[https://www.jianshu.com/p/7c5447517de3] ...