清竹饮酒

单细胞分析不可避免的会涉及到鉴定不同细胞类型的功能或比较相同类型在不同状态下的功能差异，因此，功能分析在单细胞分析中相当重要. 功能分析的方法很多，这儿我们主要讲述3种功能分...

生信云笔记

  最近一直在学习单细胞方面的知识，无意中看到别人的帖子在分享如何画堆叠的小提琴图(StackedVlnPlot)，顺便就学习了一下。发现StackedVlnPlot图确实看...

期待未来

前瞻性的研究 前瞻性的研究(prospective study)是以现在为起点追踪到将来的研究方法，可弥补回顾性研究的缺陷。 例如临床心理学实验中，对一批A型行为类型者使用自...

小洁忘了怎么分身

前言 我是在y蜀黍的书里(搜索clusterProfiler book 即可找到)看到了一个叫msigdbr的包，就是把MsigDB的那些基因集合都R语言化了。那么以后想做G...

Seurat_Satija

看过很多GEO数据挖掘的教程，一直都是芯片数据举例。我自己也根据流程（Taolu）分析过好几个geo芯片数据。一直有个疑惑， GEO上都是芯片数据吗？ GSE开头的都是芯片数...

周运来就是我

本书给我们提供了一个新的视角：癌症是起因于细胞核还是线粒体？目前的主流观点是癌症是一种遗传病，言下之意是基因的突变导致了基因程序化表达有规律地错乱，于是脱离正常的细胞生长周期...

周运来就是我

跟着运来兄搭建自己的生物信息小书房。趁年轻，读几本硬书，到老了慢慢反刍。 一项技术如何开启一个新的工业门类？都说21世纪是生物的世纪，生物技术如何从象牙塔里走出来，从一个领域...

清竹饮酒

很多做单细胞的研究者都提出过这个问题，是否有直接的功能能对单细胞直接进行注释，而不是繁琐的参看文献，搜索marker，人为对单细胞进行注释。单细胞真的可以实现自动化注释吗？我...