发简信
IP属地：四川
-
【Alphafold】Alphafold2题记： 其实Alphafold2刚出来的时候就看过大佬的报道和文章。2018年的AlphaFold使用的神经网络是类似ResNet的残差卷积网络，到了AlphaFold2则借...
-
整理生信工具内容
-
R语言ggplot2作图好看的配色备选配色来源于论文 https://www.nature.com/articles/s41577-022-00707-2[https://www.nature.com/artic...
-
基于Vcf文件进行基因单倍型分析单倍型，是单倍体[https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%95%E5%80%8D%E4%BD%93/304058]基因型的简称，在遗传学上是指...
-
GATK进行SNP calling
GATK(全称The Genome Analysis Toolkit)是Broad Institute开发的用于二代重测序数据分析的一款软件，里面包含了很多有用的工具。 需要...
-
gff3与gtf格式转换
GFF (general feature format): 可以用于任何基因组注释的存储 GTF (gene transfer format): 严格的用于基因注释信息的存储...
-
跟着Nature Communications学作图:R语言ggplot2画世界地图并用md语法添加文字标签论文 MiDAS 4: A global catalogue of full-length 16S rRNA gene sequences and taxonomy for ...
-
annovar注释非常规参考基因组的snp一、文件准备 基因组文件：r498.fa 与基因组对应的注释文件：r498.gff (最好是gtf 格式，后续需要将gff 转化为gtf ) vcf文件：fs32.vcf 二...
-
基因组与基因组之间的比较（水稻）一、准备工具 两个基因组文件： fs32.fa r498.fa (作为参考基因组) minimap2的安装： 1.conda 直接安装 conda install -c b...
-
-
R包ggplot2画散点图+循环批量画+一些基本设置之前画图用的都是师兄写好的流程，这次需要自己画一些简单的图了，中间涉及学到的一些小知识就都放这里啦，初学者，内容不是很全。 library（ggplot2）#这个应该都知道，...
