Merlin_cd6c

GEOdatabase下载了一个.loom文件，想要用一下这个数据，折磨了一周，终于成功的将它转换成了seurat对象，现记录如下：数据为GSE162183，地址：https...

七楼的白羊

本文转载自：http://www.360doc.com/content/22/0604/23/76149697_1034565139.shtml 最近在做KEGG富集分析时，...

小胡子老爷

简介   Seurat是一个r包，被设计用于单细胞rna-seq数据的细胞质控和分析。Seurat旨在使用户能够识别和解释单细胞转录组数据中的异质性来源，同时提供整合不同类型...

高大石头

CGGA[http://www.cgga.org.cn/]：Chinese Glioma Genome Atlas,中国脑胶质瘤基因组图谱计划，发布2000例中国脑胶质瘤样本...

Clariom

通常情况下，通过以下几种指标来对模型进行评价。1）区分度：采用指标C-index和ROC曲线来评价区分度，一般文章都是二选一。 C-index即一致性指数（index of ...

统计大师

需求描述 画出paper里的nomogram图和校准曲线 出自https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S1470-2045(...

张小若张小兰

因为需要对MGMT基因和胶质瘤的关系做生信分析，所以在这里收录相关文献总结和数据总结以便以后查看和更新，帖子最后附参考文献链接 概述： MGMT作为早期被发现的化疗敏感性相关...

生信start_site

下载TCGA数据的方法有很多，上一篇介绍了如何用gdc-client批量下载数据，基于网上有很多用TCGAbiolinks包下载数据的教程，所以也想学习一下这个方法。TCGA...

米开朗巨魔

TCGA临床数据的下载这里不做介绍。下载后解压数据会得到包含多个子文件夹的的文件，如下所示： 每个子文件夹下通常包含XML文件，有的也会包含多个文件。但我们需要用到的就是XM...