我的也是这样，你怎么解决的啊？
解决pRRophetic R包报错：Error in if (class(testExprData) != "matrix") stop("ERROR: "testExprData" must ...今天用pRRophetic R包时发现不能用了，出现Error in if (class(testExprData) != "matrix") stop("ERROR: \"...
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生信入门级选手，欢迎交流
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loom文件转换成seurat对象GEOdatabase下载了一个.loom文件，想要用一下这个数据，折磨了一周，终于成功的将它转换成了seurat对象，现记录如下：数据为GSE162183，地址：https...
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TCGA+biomarker——Calibration curve
通常情况下，通过以下几种指标来对模型进行评价。1）区分度：采用指标C-index和ROC曲线来评价区分度，一般文章都是二选一。 C-index即一致性指数（index of ...
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R语言代码-绘制SCI发表级的nomogram及calibration图需求描述 画出paper里的nomogram图和校准曲线 出自https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S1470-2045(...
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TCGA临床数据的提取TCGA临床数据的下载这里不做介绍。下载后解压数据会得到包含多个子文件夹的的文件，如下所示： 每个子文件夹下通常包含XML文件，有的也会包含多个文件。但我们需要用到的就是XM...
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转录组分析——利用GEO数据挖掘构建基因表达图谱一、前言 前段时间主管让我在GEO数据库弄个表达图谱，准备接下来做各种转录组分析，现在回过头来，觉得这个东西比较简单，十分适合上手练习。思考了一下，决定写下来分享给大家。注意...
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enrichplot||基因富集结果可视化解决方案enrichplot包实现了几种可视化方法来帮助解释富集结果。它支持从DOSE (Yu et al. 2015)、clusterProfiler (Yu et al. 201...
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