很久没有做拟时了，之前在官网上看到这样一个消息，我想还是需要解读和演示下monocle3。更多精彩内容请至我的公众号---KS科研分享与服务http://cole-trapn...
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Monocle3单细胞拟时分析 -
【单细胞轨迹分析】monocle3前面一篇文章介绍了monocle2，今天介绍一下monocle3。其实，Monocle3和Monocle2并没有本质上的区别，只是把降维图从DDRTree改成了UMAP。原因...
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ggplot2参数简介
ggplot2 是一个 R 语言的绘图工具包，它使用基于图层的构建方式使得代码更加可读、灵活。下面是 ggplot2 常用参数的详细解释： 1. data：需要绘图的数据集，...
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R 技巧 || 从颜色面板选取颜色取色板中的颜色 以下内容来自：https://www.datanovia.com/en/blog/top-r-color-palettes-to-know-for-great...
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单细胞marker基因展示值等高线密度图之前一个图的做法，是一篇《cell reports》上的文章，展示marker基因的表达的时候，添加上了等高线密度图，（参考：单细胞marker基因可视化的补充---密度图与...
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画热图只标注感兴趣的基因名称
做组学分析的时候，想用热图展示差异基因的情况。很多时候尤其转录组，可能得到上千个差异基因，这时候画热图不可能将所有基因的名称显示，一方面太啰嗦，一方面放不下。那么这种既想展示...
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单组火山图和多组火山图展示差异表达基因（DEGs） 2023-10-12前言 在各种RNA测序数据中，我们几乎都避不开差异表达基因（DEGs）的分析。我们可以用气泡图，提琴图和热图等展示不同细胞亚群或样本的差异基因表达情况，而火山图则是最直观的表...
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R可视化——图片颜色提取及应用（以jpg格式图片为例）设置工作目录、加载R包 加载图片并提取颜色 1、图片加载及预览——jpg格式图片加载主要基于imager包中的load.image()函数： 2、提取图片颜色——主要基于RI...
