影响因子：5.6 期刊： International Immunopharmacology 研究概述：脑出血后，脑实质中充满凝血酶、红细胞成分以及胶质细胞和浸润的外周免疫细胞...
IP属地：宁夏
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5.6分非肿瘤生信，单细胞+机器学习对特定基因集分析，并对关键基因进行实验验证。非肿瘤想快速发文章就这么做！ -
单细胞分析中机器学习的使用
可选模型： 机器学习模型 随机森林（Random Forest） - 一个经典的集成学习模型，适用于处理高维数据，能够处理单细胞表达数据的复杂性。 支持向量机（Support...
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单细胞测序--Seurat标准流程单细胞测序--Seurat（上）--创建对象和数据预处理 参考：https://zhuanlan.zhihu.com/p/134124866[https://zhuanlan...
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玩转单细胞(4)：单细胞相关性
参考文献： （Reference：Immunophenotyping of COVID-19 and influenza highlights the role of typ...
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monocle 轨迹图改颜色我们在采用monocle做细胞拟时序分析的时候，常常会不满意于原图的配色，而软件自带的配色是根据降维后分出的cell type进行颜色的分类的 那么我们可以通过 来完成 参考...
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10X单细胞（10X空间转录组）RNA速率分析之scVelo今天我们测试一下软件scVelo，这个软件应该很多人都用过了，但是玩的好的人，应该没几个。 加载 读取数据（loom, h5ad, csv）, 我的数据是根据velocyto...
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Seurat基因集打分函数AddModuleScore与之前学过的AUCell一样，Seurat里面自带的函数AddModuleScore也可以给细胞打分，我用之前拿的数据，把AUCell换成AddModuleScore玩一下。...
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（视频教程集）ggplot密度图-柱状图示例-legend设置-ggplot作图诸多问题详解这是我们基础内容的一个合集，我们之前说过，合集不会仅仅说一个帖子，而是将众多的问题一并解决。这里我们首先是复现演示了微信群小伙伴提出的单细胞密度图的作图，从这里出发，我们还演...
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单细胞UMAP图只标记特定细胞群、圈定细胞群及坐标轴修改
最近有小伙伴私信我，如下的单细胞UMAP图怎么做？是啥样的图呢？就是UMAP图上其他群是灰色的，只有某个群或者某几个群是标记颜色的，比较突出。其实很简单，一种办法可参考我们之...
