1. RAxML 简介 RAxML (Random Axelerated Maximum Likelikhood) 能使用多线程或并行化使用最大似然法构建进化树。 2. RA...
IP属地：山西
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RAxML 构建进化树
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学习笔记<br>研究方向: 植物群体遗传学<br>
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专注WGBS Chipseq等数据分析<br>perl python R脚本编辑处理数据
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通过多序列比对找到保守区域序列标识图 sequencelogo 工具使用 使用在线的工具，WebLogo3 字母大小都是根据上方的运算求得的，通常来说出现次数多的字母，体积也就越大，而如果某一列只有一...
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如何使用SPDE进行基因家族分析---蛋白结构域、启动子元件、保守结构域在进化树建完后，需要对序列的结构进行分析。这里需要区分两个概念，即蛋白结构域与保守结构域，它们两个不是一回事。从上一章，通过pfam方法同学们可以获得蛋白结构域的信息（即结构...
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Motif中的PWM矩阵PWM矩阵是表示motif的一种方式，全称是position-specificweightmatrix(PSWM)或者是position-specificscoringmat...
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基因家族生信分析基础，基础到教你序列下载的那种基础！（二）前期回顾：基因家族生信分析基础，基础到教你序列下载的那种基础（一）[https://www.jianshu.com/p/c4f3f2bab596] 写在前面：还是这门售价为 ...
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CFVisual绘制Motif+基因结构+结构域+进化树+启动子图的单独或组合图1. 软件简介 CFVisual_V2.1软件是一款借助Python语言的matplotlib库和PySide2库进行生物序列结构绘图的数据可视化软件，主要用于生物信...
