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0.NMF NMF是非负矩阵分解，也是常用的划分亚组（亚型）的聚类方法之一咯。 代码主要参考了帮助文档和曾老板的博客：http://www.bio-info-trainee....

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HPA数据库（Human Protein Atlas）是基于蛋白组学,转录组学以及系统生物学数据，可以绘制组织、细胞、器官等图谱。不仅收录了肿瘤组织，也涵盖了正常组织的蛋白表...

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0.需求解读 这是富集分析比较常见的一个图，左图右表。 图的最外层是GOterm的编号，中间灰色背景层表示基因的logFC分布，可以看到每个term对应到的市上调基因还是下调...

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欢迎关注公众号“生信小课堂” TCGA数据分析课程：生物信息学教学 今天继续我们TCGA在线数据库系列。今天介绍的数据库是LinkedOmic,http://www.link...

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Cox 回归模型 写在最开头：诚心推荐解螺旋麦子的Cox回归模型R教学视频！！！如果你对cox还稀里糊涂的，下面的链接，点！15分钟就能GET超级舒爽的代码~【Cox回归的R...

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参考：山东大学 基础医学院 之前的博客我们讲了生物数据库之核酸数据库。这次我们来讲蛋白质数据库。蛋白质数据库的种类比核酸数据库要多，但它的注释要比核酸数据库直白得多。像核酸数...

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一.问题描述：windows本地调试Hadoop程序时报错错误信息： 其原因是需要在windows本地搭建Hadoop环境，下载winutils文件，并将hadoop-2.8...

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日常掰虾   前面学习了DNA甲基化的基础知识，也了解了它的重要性，不知道的同学看这里，DNA甲基化知识概述[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz...

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Consensus Clustering(一致性聚类)，无监督聚类方法，可根据不同组学数据集将样本区分成几个亚型，从而发现新的疾病亚型或者对不同亚型进行比较分析。 Conse...

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原文链接：关联分析(3):Apriori R语言实现 微信公众号：机器学习养成记 搜索添加微信公众号：chenchenwings 在关联分析(1):概念及应用中我们介绍了关...

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熊金波实验室出品 整理归纳：Larry 本次学习使用的服务器IP地址和其用户名账户密码如下： 地址：gs0.genek.tv 用户名：u3276 密码：genek.tv（建议...

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TCGA的样品编码方式（barcode)

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在我们的工作中，常常会有将一段未知或已知核苷酸序列（DNA/RNA）翻译成氨基酸序列的需求。如果编程基础过硬的话，自己写个代码翻译三联密码子，正义链和反义链各三个移码阅读框。...

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1.生存曲线 基础包survival+扩展包survminer。 survival包内置肺癌数据集lung。 生存曲线进一步修饰。 其他类型生存曲线绘制。fun参数默认pct...

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1. Odds Odds 的意思为机率、可能性，是指某事件发生的可能性(概率)与不发生的可能性（概率）之比。假如某药物有疗效的比例为p1，则无效的比为1-p1，则odds的计...