发简信
IP属地：浙江
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【随笔】既来之则安之
临毕业不到2年，临床博导一锤定音拒绝湿实验，让我们就做生信！谁能想到，导师本身没有生信背景，却要求自学生信呢？ 拖到现在还剩1年多，我的科研进展...
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【搬砖】计算HRD（first try）HRD score = LOH + TAI + LST 参考：Sztupinszki et al, Migrating the SNP arra...
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【科研工具】Zotero+Zotfile+坚果云实现mac ipad端同步一直用endnote，电脑端用得还行，但是个人觉得endnote不同终端的同步有点慢。转手学习Zotero配合坚果云同步，实现ipad端阅读文献...
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【血的教训】样本名对应！
看到这条的朋友们赶紧打开你们的代码，看看你们的matrix列名和临床数据里的样本名的顺序有没有对应上，特别是做过combat合并处理的datas...
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【搬砖】整理datasets——去除批次效应背景 上次选择了一个新开发的跨平台归一化工具 MatchMixeR，（失败了），但是在文章里发现作者把自己的工具与已有的工具进行比较，顺藤摸瓜发...
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【搬砖】【MatchMixeR无法使用】对不同GPL的microarray测序结果归一化分析GEO下载下来的文件，通常单个GEO文件内包含的样本量不够大，用起来结果不太好，因此往往需要考虑将多个GEO文件汇总呈一个compile。G...
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GPL文件 一个探针对应多个symbol 整理成data.frame 【已解决】虽说简单，但对R语言不熟悉的人来说还是需要指点一下，才会用。首先是GPL下载的文件，以GPL96为例。 提取最感兴趣的3列。 好的，接下来需要得...
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【搬砖】构建预后signature 实践Cox 回归模型 写在最开头：诚心推荐解螺旋麦子的Cox回归模型R教学视频！！！如果你对cox还稀里糊涂的，下面的链接，点！15分钟就能GET超...
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【简单掌握】不同基因表达间的相关系数计算及作图相关系数计算：相关系数、P值 相关系数作图 补充ggcorrplot 更详细的作图细节可参考：https://www.jianshu.com/p...