临毕业不到2年，临床博导一锤定音拒绝湿实验，让我们就做生信！谁能想到，导师本身没有生信背景，却要求自学生信呢？ 拖到现在还剩1年多，我的科研进展有限，最关键的是在学习热情乃至...
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【随笔】既来之则安之
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【动植物研究动态】2022年1-3月收藏的文献
微信收藏夹中的文献解读，只整理出今年2022年已收藏的部分文献，之前的太多，不列了。后续计划每周更一次，自己会看得更认真点，解读更详细些。 Nature Genetics |...
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【R报错】解决Linux下安装clusterProfiler：object 'get_fun_from_pkg' not found
报错 R version 4.0.3 $RBiocManager::install("clusterProfiler") 解决 原因是rvcheck版本太旧。 1.重新安装...
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WGCNA分析，简单全面的最新教程本文应该是第二全的WGCNA分析教程，参考了最新的文档。第一全的还在路上，会出现于生信宝典和宏基因组公众号组织的二代三代转录组测序分析实战班上，欢迎点击链接了解更多。 WGC...
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TCGA差异分析|2.DESeq2DESeq2真狠，TCGA-PRAD数据差异分析用了半个小时，而且还是多线程。这速度也没啥提升呀 声明：本文仅供学习交流用，禁止用于商业用途，如有侵权，请联系删除。参考链接：...
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【搬砖】计算HRD（first try）HRD score = LOH + TAI + LST 参考：Sztupinszki et al, Migrating the SNP array-based homolog...
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Rstudio包管理一网打尽，最全的R包管理终极教程Rstudio/R的包（package）管理是个老生常谈的问题，很少有人去总结，因为大家都认为比较简单。今天我就把所有的安装和管理R包的方法一起写一写。 一、包在哪里？ CR...
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单基因的肿瘤细胞系表达怎么看？CCLE告诉你泛癌的基因表达量一般可以用TCGA和GTEx实现，但是肿瘤细胞系一般用CCLE临床生信之家[https://www.aclbi.com/static/index.html#/...
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处理CLIP-seq数据的方法总结
CLIP-seq结合了实验和测序方法，可以研究某种蛋白质在体内的RNA的结合情况。原理为基于RNA和RNA结合蛋白在紫外线照射下发生偶联，再经过蛋白特异性抗体将其沉淀，回收片...
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【科研工具】Zotero+Zotfile+坚果云实现mac ipad端同步一直用endnote，电脑端用得还行，但是个人觉得endnote不同终端的同步有点慢。转手学习Zotero配合坚果云同步，实现ipad端阅读文献做笔记，并可在电脑端同步阅读。...
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当来到运动系统时，你会想到什么？如题：当来到运动系统时，你会想到什么？以什么问题的切入，将直接决定我们在一开始见到它时它呈怎样的面目。如同我们要去了解一个陌生人，我们也总是会先想几个问题，然后与之交流，以图...
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9. 学习与记忆的相关脑区【整理】 —— 认知神经科学系列文学习记忆是大脑最基本也是最重要的高级神经功能之一，一般认为，学习主要是指人或动物通过神经系统接受外界环境信息而影响自身行为的过程， 记忆是指获得的信息或经验在脑内贮存和提取（...
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NGS二代测序技术与转化医学研究--3.溶瘤病毒denovo组装溶瘤病毒基因组denovo[http://blog.sciencenet.cn/blog-635619-902677.html]组装 溶瘤病毒[http://www.s...
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NGS二代测序技术与转化医学研究--2.RNA-seq部分RNA-seq转录组测序 与cfDNA体细胞突变检测相比，基因表达相关的RNA-seq转录组测序在常规的mRNA、非编码RNA[http://www.ibp.cas....
