请问plantcare现在是不维护了吗，现在打不开了耶
顺式调控元件-数据分析模块（上）基因启动子顺式元件分析是研究基因表达调控的重要手段之一。 基因启动子（promoter）是位于基因上游的一段DNA序列，负责调控基因的转录。启动子中包含许多特定的DNA序列，...
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基因家族分析（一）软件的准备
基因家族分析软件安装指南 在基因家族分析的世界里，软件安装是开启探索之旅的第一步。准备好迎接挑战了吗？让我们一起开始吧！ 第一章：基因家族分析软件安装 1.1 使用 Cond...
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曼哈顿图--R可视化曼哈顿图(Manhattan plot)是一种GWAS分析中常用的展示基因组数据的散点图。可以R语言中的qqman、CMplot及ggplot2三个包绘制曼哈顿图。 基于qq...
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vcf 2 hammp 2024-03-18
第一步，利用GATK中 VariantsToTable 将vcf文件格式转化 第二步：使用如下R脚本将变量表转换为hapmap。 注意：仅仅在单倍体，双等位基因型SNP中得到...
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重测序分析（17）GWAS分析实操（3）gwas_tassel_glmTASSEL利用固定效应线性模型来测试分离位点和表型之间的关联。该分析可以选择使用指示基础总体成员程度的协变量来考虑总群结构。仅主效应模型是使用输入数据中的所有变量自动构建的...
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使用HMM进行基因家族鉴定？无人不能。写在前面 很久很久以前，各种原因，我写过一个帖子，《零基础-完全重现某个基因家族分析文章（的分析部分）》 https://www.jianshu.com/p/88075f6c...
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