在使用cellphoneDB和italk进行细胞通讯分析时，发现小鼠的结果很少或奇奇怪怪。查了下网上大家的一些解决办法，发现将小鼠的基因转成人的同源基因即可做。 这篇文章主要...
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小鼠和人的同源基因对应 -
CellChat三部曲1：使用CellChat对单个数据集进行细胞间通讯分析CellChat三部曲1：使用CellChat对单个数据集进行细胞间通讯分析 自从周运来在简书写了一篇cellchat的中文介绍教程，然后R包作者也在B站做了直播介绍，cel...
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单细胞测序PBMC数据iTALK细胞通讯分析详细演示准备工作，此操作过程根据简书"http://www.jianshu.com/p/dfe35a2a02d4[https://www.jianshu.com/p/dfe35a2a...
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iTALK---单细胞受配体互作分析及可视化（详细版教程）今天我们说一说另外一种---iTALK，iTALK也在很多文章中出现过，原理是基于受配体平均表达量。它有两个优点，第一是可以比较差异受配体，第二是可视化比较好，我们可以借用借...
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细胞通讯-iTALK使用方法作者：ahworld链接：细胞通讯-iTALK使用方法来源：微信公众号-seqyuan著作权归作者所有，任何形式的转载都请联系作者。 什么是细胞通讯？ 多细胞生物由不同类型的...
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单细胞 （小鼠）| 差异分析＋GSEA通路富集
教程：FindMarkers做差异分析默认就不会返回全部基因 - 腾讯云开发者社区-腾讯云 (tencent.com)[https://cloud.tencent.com/d...
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转录组分析（三）--GO及KEGG富集分析及可视化（包括条形图及气泡图）（对差异基因的可视化）
GO分析（上下调基因分开做，可用于BP,CC,MF分开画图） GO分析（上下调一起做，强烈推荐，可以看整体结果，并可选取其中的部分画图） GO 条形图（上下调一起，不过BP,...
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小鼠基因富集分析之任何通路
今天忙里偷闲，自创了一套基于小鼠基因list的富集分析方法，主要原理是将之前用于人的基因富集分析方法搬运到小鼠上，大家可以各抒己见，在下方留言。 那么，开始展示 故事要从一个...
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SCENIC单细胞转录因子分析1. 简介 SCENIC（single-cell regulatory network inference and clustering）是一个基于共表达和motif分析，计...
