根据浙科版高中生物学选修一38页淀粉水解流程图的描述,很容易让人误以为三者的作用底物分别为淀粉、糊精和麦芽糖,为了便于理解几类淀粉酶的作用,先需要辨析两组概念:直链淀粉与支链...
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引用文章标题:Insights on the Evolutionary Genomics of the Blautia Genus: Potential New Specie...
基因组组装一般分为三个层次,contig, scaffold和chromosomes. contig表示从大规模测序得到的短读(reads)中找到的一致性序列。组装的第一步就...
snakemake是一个用来编写任务流程的工具,用python编写的,因此其执行的流程脚本也比较通俗易懂,易于理解。 一、从一个简单的例子开始 1、安装snakemake 安...
Git LFS是git支持大文件的一个工具。例如,大于100M的文件,多了之后用Git管理,经常会卡死。从Git 1.8之后的版本开始支持。有了Git LFS,可以大幅度提升...
Module 0:试运行 VIRGO 本模块概述了如何测试 VIRGO 以确保其按预期工作。在目录 testrun 中包含测试数据集: 运行 step1 和 step2 脚本...
VIRGO网站:https://virgo.igs.umaryland.edu/[https://virgo.igs.umaryland.edu/]VIRGO 是人类阴道微生...
FastQC下载及安装 FastQC是一个java软件,下载后可以直接使用,免安装编译,但需要先配置java环境。 一、Java环境配置 首先,确定java是否已经配置好。 ...
什么是组间差异检验?就是组间的差异分析以及显著性检验,应用统计学上的假设检验方法,检验组间是否有差异及其差异程度。坦率地讲,所有的差异检验都基于一个假设:组间没有差异,变量之...
差异代谢物分析 差异代谢物分析包括多元统计分析和单维统计分析,其中多元统计能捕捉到具有相互关联的差异性变量有利于代谢调控网络研究;单维的统计能独立分析单个变量的统计学意义,在...
OPLS-DA:正交篇最小二乘法判别分析 原理: OPLS-DA不同于PCA,它是一种有监督的判别分析统计方法。运用偏最小二乘回归建立代谢物表达量与样本类别之间的关系模型,来...
1.绘制散点图 2.去除背景色 3.去除网格线
摘要: 低剂量的、不会杀死细胞的辐射处理会对病理学的临床表现造成强烈的影响,包括微生物和宿主基因表达的变化。尽管肠道微生物对维持人类身体健康的必要性已经广为人知,但是辐射对微...
1.创建工作目录kraken2并进入工作目录 2.将去除引物和barcode的序列放入工作目录,格式为.fastq 3.下载数据库 4.解压 5.注释 6.获得相对丰度
群落丰富度(Community richness)的指数:指一个群落中物种数目的多少 Chao指数:是用Chao1算法估计样品中所含OTU 数目的指数,Chao1 在生态学中...