IP属地:山东
Module 0:试运行 VIRGO 本模块概述了如何测试 VIRGO 以确保其按预期工作。在目录 testrun 中包含测试数据集: 运行 s...
VIRGO网站:https://virgo.igs.umaryland.edu/[https://virgo.igs.umaryland.edu...
OPLS-DA:正交篇最小二乘法判别分析 原理: OPLS-DA不同于PCA,它是一种有监督的判别分析统计方法。运用偏最小二乘回归建立代谢物表达...
1.绘制散点图 2.去除背景色 3.去除网格线
摘要: 低剂量的、不会杀死细胞的辐射处理会对病理学的临床表现造成强烈的影响,包括微生物和宿主基因表达的变化。尽管肠道微生物对维持人类身体健康的必...
1.创建工作目录kraken2并进入工作目录 2.将去除引物和barcode的序列放入工作目录,格式为.fastq 3.下载数据库 4.解压 5...
群落丰富度(Community richness)的指数:指一个群落中物种数目的多少 Chao指数:是用Chao1算法估计样品中所含OTU 数目...
VM:阴道微生物群LVM:乳酸菌为主的阴道微生物群DVM:阴道微生物菌群失调的阴道微生物群Comparative genomics:比较基因组学...
1.构建系统发育树 2.稀释曲线 3.多样性分析1)根据ASV的最小测序深度设置sampling参数 2)alpha多样性分析-faith_pd...