放在最前面的涉及的链接和意外收获 翻译原文链接 意外收获1、Boundless Biology 意外收获2、Book: General Biology (Boundless)...

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前言 近期分析了一部分小麦的全长转录组数据,参考了网上许多流程,收获良多,在此记录一下 全长转录组测序基于PacBio单分子实时测序技术(SMRT cell),凭借超长读长的...
服务器部署简介 之前学过一点点R shiny,但只是自己随便在本地R中试用,没试过部署服务器。最近老板要我写个小工具供用户使用,没搞过,头有点大。 一般地,可将shiny部署...
测序容易,解读困难 现在大部分同学做转录组实验都是让测序公司去分析,经过了那么多年的发展,公司提供的分析结果也是越来越丰富了,光结题报告就有几十页,结果文件有几百兆甚至超过1...
[连锁不平衡粗俗的说就是:这几个基因耍流氓,喜欢抱团遗传,不再随机。而连锁不平衡衰减是指在基因组上,随着物理距离的增大,两个连锁的的等位基因的连锁程度不断减小。] LD衰减图...
放一张效果图,这些,三四年前的东西,我其实一直懒得说。 写在前面 “Gene Structure View (Advanced)”这个功能可以说,也是一时兴起写出来的。开发的...
使用说明http://snpeff.sourceforge.net/SnpEff_manual.html 软件安装 下载最新版本,并解压即可使用。wget https://s...
问题起因:在用gatk进行HaplotypeCaller时,报错 原因是在用hisat2或者bwa比对是没有添加RG;hisat2(参数为--rg),bwa(参数为-R) 而...
我们知道,GATK 4 多个样本joint genotyping用模块GenotypeGVCFs, 目前GenotypeGVCFs只支持以下三种形式的输入文件:1)a sin...