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发简信
IP属地：上海
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那令人困惑的比对工具选择啊~
写在前面的废话 我可能不适合做科研，因为我总是对一些“没有必要”的事斤斤计较~ 刚开始接触二代测序时，是跟着Jimmy大神从RNA-seq开始入门的。那时候使用的比对工具是H...
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使用htseq-count进行定量分析和featurecounts一样，htseq-count也是一款进行raw count定量的软件。该软件采用python语言进行开发，集成在HTseq这个包中。 对于pyth...
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西澳大学生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因组与群体基因组学的挖掘<br><br>简信不回答问题，有问题发至<br>lakeseafly50@gmail.com
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@许东 是不是类似于blastx呢？
diamond & blast：DNA蛋白序列比对
导读 用query基因、DNA序列、16S扩增子序列、蛋白序列比对基因注释、物种注释 、基因功能注释数据库。Blast准确性高，速度慢。Diamond速度更快，常用于二代测序...
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Mash: 使用MinHash快速估算基因距离
工具介绍 Mash扩展了MinHash降维技术，使其成对的突变距离和P值显着性检验，从而可以有效地聚类和搜索大量序列集合。混搭将大序列和序列集还原为较小的代表性草图，进而可以...
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你好，我在看一边文献，上面有方法展示了怎么处理这个零值，需要交流一下吗？
微生物组数据的centered log-ratio transformation
在分析肠道微生物数据中，一般会对数据进行一定的转换，以使数据尽可能的服从正态分布。常用的方法有Centered Log-ratio (CLR) transformation...
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微生物组数据的centered log-ratio transformation在分析肠道微生物数据中，一般会对数据进行一定的转换，以使数据尽可能的服从正态分布。常用的方法有Centered Log-ratio (CLR) transformation...
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群落多样性之Alpha多样性（一）
学习生物学，一项很重要的事情就是理解概念。有一种方法就是直接从名字上理解概念。小RNA，是不是就是很小的RNA？宏基因组，是不是就是很“宏”的基因组？……答案很统一：必须是啊...