因为样本数量比较可观,所以可以进行WGCNA分析。这里是并不需要选取所有的基因来做WGCNA分析,挑选的标准可以是top变异程度大的基因集合,或者显著差异表达的基因集合等等。...

因为样本数量比较可观,所以可以进行WGCNA分析。这里是并不需要选取所有的基因来做WGCNA分析,挑选的标准可以是top变异程度大的基因集合,或者显著差异表达的基因集合等等。...
本教程根据PlantTech的WGCNA课程编写,课程还是不错的,所以将该课程给大家分享一下。 WGCNA笔记第一弹 WGCNA分析原理 WGCNA应用场景 WGCNA分析实...
WGCNA 分析确定重要模块之后,如何找模块内的hubgene? 想找hubgene,必须先理解其概念:网络中处于核心位置的点(基因)。在WGCNA中,由于进行了无尺度化处理...
蛋白质组知识背景 蛋白质组(proteome):由一个细胞、一个组织或一个机体的基因组所表达的全部相应的蛋白质,是一个整体的概念。 蛋白质组学(proteomics):以蛋白...
通过前期的分析,我们确定了感兴趣的module,但是module中又含有几十甚至上百的基因,下一步需要进一步筛选hub gene。 WGCNA(3):基因模块与性状关联识别重...
1.简介 2016年,德国马普所的Cox和蛋白质组学领域巨擘Matthias Mann合作开发了MaxQuant软件(MQ),并发表在nbt上,protocol也相应发表在n...
前言 关于蛋白质组学,你是不是已经听了太多公司的宣讲,介绍了一大堆的技术名词,反而越听越懵懂,脑袋一团乱麻?就和传话游戏一样,当我们接收了多手信息以后,得到的信息就越不准确。...
写在前面 因为我研究的物种比较小众,很多注释不完全,R包AnnotationHub中也没有对应信息,所以无法使用公共数据库进行kegg富集分析。所以自己尝试使用KAAS造一个...
GATK4流程学习之背景知识与前期准备 - 简书[https://www.jianshu.com/p/97e803755fa6]GATK4流程学习之DNA-Seq varia...