CellPhoneDB作为出镜率很高的细胞互作分析工具,也是大家公认的。网上有很多教程,按理说在自己单细胞系列也应该出一个教程,但是由于CellPhoneDB是基于pytho...
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细胞配受体通识以及常见细胞分泌信号通路[https://www.jianshu.com/p/df4721d29a91]CellChat:细胞间相互作用分析利器[https:/...
1. 两种基因功能富集方法介绍 名词解释:1. 基因功能富集分析:包括过表达分析ORA、功能分类打分FCS、基于同路拓扑结构PT和基于网络拓扑结构NT和基因富集分析GSEA。...
简介和前期文章 我对之前的所有教程进行了再次详细的总结CRISPR-Cas9基因编辑之背景介绍及gRNA设计(上) 前言: 在上一次文章中,我们已经得到了在线工具设计的sgR...
果子老师做过一个非常惊人的举动,用DESeq2处理1225例样本的TCGA数据,在没有使用DESeq多线程参数parallel的情况下,跑了将近40个小时。 那么问题来了,在...
ID转换过程中会有基因丢失这件事情,在部分做干实验的人看来,是非常正常的。但不做干实验的湿实验人知道这件事,心里可能会有疙瘩。为什么要丢失呢?为什么丢失了不补回来? 在分析结...
1.技术重复 同一个样品测多次。例如给某伙计取血样,测5次基因表达量 能得到的信息 1.这伙计精确的基因表达量2.基因表达量测量方法的准确程度(看多次测量的重复性好不好) 使...
前言 目前我的课题是植物方面的单细胞测序,所以打算选择植物类的单细胞测序数据进行复现,目前选择了王佳伟老师的《A Single-Cell RNA Sequencing Pro...