参考学习GEO提供的GEO2R在线差异分析工具使用的代码流程。笔记里的代码在理解每一步的基础上,部分做了修改。但大致思路不变,即使用limma包对芯片测序数据进行差异分析(暂...
轨迹分析系列: 单细胞之轨迹分析-1:RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析(Pseudot...
昨天我在单细胞天地讲解了使用monocle2进行拟时序分析的方法,基本上跟着我的代码走一波就可以学会了,当然具体参数理解需要自行发力哦,见:使用monocle做拟时序分析(单...
1. 三个目录 R_HOME、HOME、working directory。 R_HOME: the directory in which R is installed. F...
复杂性状的细胞类型表达特异性整合(CELLECT)是一个计算工具包,用于识别复杂性状潜在的可能病因细胞类型。CELLECT利用现有的遗传优先级模型,在识别可能的病因细胞类型时...
前段时间跟师兄聊天,聊到seurat包,他说学软件一定要知道这个软件开发的目的,它是要解决哪些主要问题,哪些是次要问题,次要问题其他R包同样解决,他开发的主线是什么。单细胞多...