主成分分析(PCA)是一种线性降维方法，能从纷繁复杂的数据中抽离出关键因素，用来区分不同的样本。这里我们不谈PCA背后的数学原理，只谈哪些软件能够处理数据，我找到了以下三款 ...
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「群体遗传学实战」第二课: 画出和文章几乎一样的PCA图 -
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XP-CLR选择信号
检测基因组选择信号的方法有很多种，其中 XP-CLR 方法是常用的一种。XP-CLR 是陈华老师、Nick Patterson 和 David Reich 在 2010 年发...
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3.1 GWAS：表型鉴定与记录的基本原则和原始数据处理精确的表型检测是关联分析的关键，GWAS对数量性状和质量性状都适用。 1.各类性状的特点及鉴定与考察建议 2.表型的基本处理 2.1 正态性检验 关联分析属于线性模型，要求...
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ggplot2拟合曲线图（从0开始，刻度向内）就是这个图，以前都是用graphpad做，我觉得R语言一定可以实现，就试了一下。 0.思路 1.找到ggplot2做曲线图的函数--geom_smooth。2.ggplot2...
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关注：生物统计，数量遗传，混合线性模型，生物信息，R，Perl，Python，GWAS，GS相关方法，文章及代码<br>
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【内容】：于我来说，科普和武侠，看似矛盾，却是相通的。<br><br>【个人】：生物信息学学士，经济学硕士在读，热爱武侠的国内首批基因健康管理师，现在已经辞职在手工制作方面创业。<br><br>【原创】：全部原创文章已经授权“维权骑士”处理侵权。未经授权，不能转载。<br><br>【其他】：谢谢关注文集的各位，阅读就是一种善意。
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一个人，只要他够胖，哪怕他认真地在看书，都像在点菜.
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测序数据的深度、覆盖度等计算Coverage Depth 覆盖深度 mapping depth 基因组被测序片段（短读 short reads）“覆盖”的强度有多大？ 每一碱基的覆盖率是基因组碱基被测序...
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测序数据基本信息统计 | reads,coverage,depth
00 写在前面 测序后公司交付数据时，一般会提供质控后的clean data和后续的基础分析结果。因为可能需要自己来进行数据的预处理，记得一定要拿回raw data，同时弄清...
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传说中的 “bio生物信息” 首席编辑
