生信编程日常

GSEA的介绍：https://www.omicsclass.com/article/230GSEA有相应的软件，其实clusterProfiler除了做go term 富集...

Wei_Sun

韦恩图，Venn diagram，常用图的一种，用来展示集合之间的特异性和共同性。现在有很多在线的网站都可以绘制，但是R来画也方便，其中ggvenn是基于ggplot2的专门...

Hayley笔记

AUC允许在单细胞rna数据集中识别具有活性基因集（如gene signature,gene module）的细胞。AUCell使用曲线下面积来计算输入基因集的一个关键子集是...

小洁忘了怎么分身

AUCell 1.提取指定GOterm的基因 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7606976/[https://ww...

生信杂谈

WGCNA分析基于两个假设：1.相似表达模式的基因可能存在共调控、功能相关或处于同一通路，2.基因网络符合无尺度分布。基于这两点，可以将基因网络根据表达相似性划分为不同的模块...

Kevin_Hhui

这篇文章在2020年7月上传到了bioRxiv（Inference and analysis of cell-cell communication using CellCha...

PhageNanoenzyme

以下文章来源于生信会客厅[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI1Njk4ODE0MQ==&mid=2247488442&idx=1&sn=...

jjjscuedu

其实我一直没用过WGCNA，因为分析网络的方法有很多，但是大家好像都更爱用这个。最近帮人分析的几组数据，他们指名要用WGCNA分析，所以就学习一下。 =======WGCNA...