想让这张图当封面 1.1 关于 easyPubMed 作者是 Damiano Fantini ，2019-03-29 发表，甩链接。 看它的 Title: 搜索和读取 Pub...
发简信
IP属地：山东
-
R包安利 ① easyPubMed—PubMed利器 -
10X空间转录组数据分析之细胞的空间依赖性作者，追风少年i hello，大家好，周五了，马上大家就可以过一个美好的礼拜天了，不过现在还是工作的时间，今天分享一个分析细胞类型空间依赖性的代码，分析的结果如下图所示： 谈...
-
单细胞图表之细胞比例条形图和自定义UMAP图1.数据 sce.all 是seurat 标准流程+singleR注释好的对象。 2.条形图 展示每个病人的各种细胞的比例，堆叠式的直方图 3.自定义版本的UMAP图 提取出...
-
DNA甲基化差异的甲基化 差异的甲基化位点位于基因的prometer区域，我们才去保留，主要包括（TSS200和TSS1500） 注释文件来自ChAMP工具包，data一下即可 一般的差...
-
R绘图之RGB 配色表
一些有用的链接： RGB 配色表[https://www.cnblogs.com/xianghang123/archive/2012/06/13/2547604.html]：...
-
DoHeatmap的优化+ComplexHeatmap绘制带特定基因的单细胞热图单细胞绘图系列： Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2优化Seurat绘图[https...
-
从TCGA下载的甲基化数据格式解读
我的天，第一次接触甲基化数据，真是令人头大。那就先从TCGA上下载某一种癌症的甲基化数据开始吧。1、下载。数据的下载和RNA数据的下载方式是一样的，只不过你现在需要选择的是“...
-
单细胞转录组功能分析（超详细clusterProfiler,GSEA,GSVA分析）单细胞分析不可避免的会涉及到鉴定不同细胞类型的功能或比较相同类型在不同状态下的功能差异，因此，功能分析在单细胞分析中相当重要. 功能分析的方法很多，这儿我们主要讲述3种功能分...
-
GSEA 富集分析理论知识 GSEA（Gene Set Enrichment Analysis），该方法发表于2005年的Gene set enrichment analysis: a kno...
