1. Mummer详细介绍转至参考: https://www.jianshu.com/p/2e184e5c15b7[https://www.jianshu.com/p/2e1...
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「基因组」基因组共线性之Mummer -
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基于orthofinder 结果构建物种树
串联法 orthofinder 已经生成好单拷贝基因串联的序列，可以直接使用。找到orthofinder 已经生成好单拷贝基因串联的序列，SpeciesTreeAlignme...
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【转录组学】如何进行一步到位的fastq到差异分析，kallisto拯救你(一)传统转录组的分析想必大家已经非常熟悉，无非是质控 -> 比对 -> 组装 ->定量 -> 差异分析 -> 差异表达基因功能富集分析这个套路。目前公司用的流程主要也有两个门派，...
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ASE（等位基因特异性表达） —— 完整流程
前段时间，接了老师一个等位基因特异性表达的任务，前后再加上其他的分析带着做，再捋流程，拖拖拉拉也用了小一个月，终于从原始测序数据，得到了最终的那张table，具体的内容基本已...
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ASE （等位基因特异性表达）—— ASEReadCounter在遗传时，父本和母本等位基因的调控和表达不均，这被称为等位基因特异性表达（ASE，allele-specific expression analysis）。表现为基因转录出的...
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Complexheatmap::pheatmap图cell尺寸设置首先放出参考链接： https://jokergoo.github.io/2020/05/11/set-cell-width/height-in-the-heatmap/[h...
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InterPro 注释和结果可视化一、InterPro数据库简介 Interpro是集成了蛋白质家族、结构域和功能位点的非冗余蛋白质特征序列数据库。 Interpro数据库成员包括Coils 、Gene3D、...
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R语言的ggtree展示进化树的一些常用操作ggtree是R语言里对进化树进行可视化展示的一个功能非常强大的R包，ggtree的作者还专门写了一本书对ggtree的用法进行了详细的介绍，相关链接是 https://yu...
