很接近bowtie2与bwa 1. 基本流程 1.1. 建立参考基因组hisat2-build可为UCSC、NCBI、Ensembl等来源的fasta文件，多个文件以逗号分隔...
IP属地：北京
-
【块】生信上游-4 HISAT2
-
在线网站构建最大似然法系统发育树我从多灾多难的2020年的11月开始正式学习构建系统发育树，拖拖拉拉地学到12月。星座运势告诉我：“你想掌握地大部分技能都可以通过持续地坚持来获得。”我心想：信了你的邪。 下...
-
跟着Science学保守元件(Conserved Elemtns)的鉴定0.代码来源文章参考:《Large-scale ruminant genome sequencing provides insights into their evoluti...
-
NCBI组学数据上传流程论文发表之前我们常常会有递交测序数据到NCBI的需求，这些数据例如：基因组，转录组，ChIP-seq，ATAC-seq，基因组注释文件，三代测序原始数据等都有不同的NCBI子...
-
基于Vcf文件进行基因单倍型分析单倍型，是单倍体[https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%95%E5%80%8D%E4%BD%93/304058]基因型的简称，在遗传学上是指...
-
2023-03-21 | 渗入片段检测——Loter
渗入片段检测（单倍型）基因组上的哪些片段是通过基因交流获得的以及它们的生物学功能 ●适应性基因渗透包含两个过程：基因渗透和适应。●基因渗透是指遗传成分从一个群体通过有性生殖的...
-
Linux中的一些小技巧
conda软件的使用： 1、创建虚拟环境： 2、进入虚拟环境（已创建的） 3、退出虚拟环境： 4、删除虚拟环境：删除名为xxx的环境 5、查看虚拟环境： 6、安装软件： 7、...
-
-
群体遗传研究——变异注释--snpEff和ANNOVARsnpEff snpEff4.0软件之后默认下载安装所有动物的库（ensembl的库） 但是ensembl的库有个缺点就是注释出来的基因是ensemblid，我们也不认识它是...
