发简信
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Augustus 基因从头预测
目前的从头预测软件大多是基于HMM(隐马尔科夫链)和贝叶斯理论，通过已有物种的注释信息对软件进行训练，从训练结果中去推断一段基因序列中可能的结构，在这方面做的最好的工具是AU...
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随笔 | 回望过去，写满幼稚
按已有课程计划，今年会继续给研究生讲述一门《园艺植物生物信息学实践》的课程。去年授课场景，我早已忘得一干二净。能回忆起来的，大体是讲解了过多数据分析的逻辑实现，而过少实践演练...
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笔记｜三代转录组批量mapping
实验数据： 参考基因组: SCchr. fa 比对数据：#全长过滤#.fa.gz 建立索引： 软件：minimap2 minimap2批量比对 samtools sam文件转...
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跟着Nature Communications学作图：R语言pheatmap做热图展示不同软件做差异丰度分析的差异论文 Microbiome differential abundance methods produce different results across 38 datase...
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R语言正则表达式备忘单（还有好多其他R相关的备忘单）来源 https://github.com/rstudio/cheatsheets[https://github.com/rstudio/cheatsheets] 这个链接还...
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单细胞数据分析中future包的使用跑锚点整合的时候遇到报错 提示future.globals.maxSize不足解决办法参考：stackoverflow[https://stackoverflow.com/q...
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跟着Plos Biology学作图：R语言ggplot2散点图和误差线论文 Large variation in the association between seasonal antibiotic use and resistance ac...
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利用二代测序数据矫正三代Nanopore测序数据
论文 https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-020-02244-4[https://...
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R语言里可视化多序列比对（paf格式）的R包：pafrpafr包的参考链接 https://cran.r-project.org/web/packages/pafr/vignettes/Introduction_to_pafr....
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可能会用到的R语言包~5
1 ggpmisc 添加回归曲线 2 ComplexUpset 维恩图 3 colorfindr 提取图片中的配色 4 flextable 统计模型快速出表格 参考微信公众号...
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罗振宇2022年跨年演讲这几点刷新了我的认知俞敏洪老师说：“拉开人与人的差距不是金钱，物质层面的，而是认知的差距”。 是的，无知的认知，愚味的认知是很可怕的。 比如在罗振宇跨年演讲中有几点重新刷新了我的认知世界。...
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终于拿到了过千的稿酬，然后就被一位清高的文人鄙视了昨天是一个值得庆祝的日子，除了是腊八节，并且还是中国人民警察节之外，还是小说平台结算稿费的日子。 虽然之前也给公众号投过稿，也在头条上提过现，简书上也攒了一点简书贝，但每次也...
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2022年，我要读完这25本书今天为大家整理了25本好书，我做了四个分类:写作类、认知类、育儿类、心理类。 有些我已经读过，觉得极好才拿出来分享。有些是我看了一些知名作者的推荐，精心筛选出来的。 今年，我...
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我的生信自学心得分享
这是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 从2016年，我开始自学生物信息，那个时候，为了加深自己学习，所以就不间断的在网上分享我的学习笔记。 我有一个自己的博客，xu...
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文献学习020--[sc]单细胞核测序揭示扩心病儿童细胞特征调节的新机制1. Age-Dependent Changes in Cellular Composition in Pediatric DCM 作者对6例因终末期扩心病进行心脏移植的患儿...
