实验数据： 参考基因组: SCchr. fa 比对数据：#全长过滤#.fa.gz 建立索引： 软件：minimap2 minimap2批量比对 samtools sam文件转...
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IP属地：云南
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笔记｜三代转录组批量mapping
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Augustus 基因从头预测
目前的从头预测软件大多是基于HMM(隐马尔科夫链)和贝叶斯理论，通过已有物种的注释信息对软件进行训练，从训练结果中去推断一段基因序列中可能的结构，在这方面做的最好的工具是AU...
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随笔 | 回望过去，写满幼稚
按已有课程计划，今年会继续给研究生讲述一门《园艺植物生物信息学实践》的课程。去年授课场景，我早已忘得一干二净。能回忆起来的，大体是讲解了过多数据分析的逻辑实现，而过少实践演练...
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跟着Nature Communications学作图：R语言pheatmap做热图展示不同软件做差异丰度分析的差异论文 Microbiome differential abundance methods produce different results across 38 datase...
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R语言正则表达式备忘单（还有好多其他R相关的备忘单）来源 https://github.com/rstudio/cheatsheets[https://github.com/rstudio/cheatsheets] 这个链接还...
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单细胞数据分析中future包的使用跑锚点整合的时候遇到报错 提示future.globals.maxSize不足解决办法参考：stackoverflow[https://stackoverflow.com/q...
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跟着Plos Biology学作图：R语言ggplot2散点图和误差线论文 Large variation in the association between seasonal antibiotic use and resistance ac...
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利用二代测序数据矫正三代Nanopore测序数据
论文 https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-020-02244-4[https://...
