作者，Evil Genius 虽然我们最近在上单细胞空间的系列课程，但毕竟现在在临检公司，我们这次分享一点不一样的东西，知识面的扩展，对大家科研项目很有帮助。 至于为什么不在...
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肿瘤复发检测手段---MRD -
单细胞大样本量数据处理新方法||Simpler single cell RNAseq data clustering聚类是分析单细胞RNA序列（scrna-seq）数据的一种常用分析方法，但数据量的快速增长会使这一过程在计算上具有挑战性。准确高效聚类的新方法是迫切需要的。本文提出了一种基于...
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如何看待复大发布国内首个ChatGPT模型"MOSS"Hi, Moss. 2 月 20 日晚，复旦大学自然语言处理实验室发布了国内首个具备 ChatGPT 能力的语言模型 ——MOSS，并面向大众公开邀请内测。 MOSS 体验链...
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细胞通讯分析【二】——CellChat分析结果可视化本期内容同步发布于单细胞天地微信公众号。 回顾——细胞通讯网络构建 前面的帖子中我们已经成功地进行了细胞间通讯网络的构建，总的来看借助下面简易的分析流程即可完成： 今天继续介...
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RNA-seq：STAR 软件比对（SLURM递交系统）
索引构建 构建好索引后，第一次比对 构建二次比对的新索引： PSSTAR缓存文件太大，7TB空间run 190个RNA-seq都吃不消，还是用For循环来做。
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单细胞数据分析中future包的使用跑锚点整合的时候遇到报错 提示future.globals.maxSize不足解决办法参考：stackoverflow[https://stackoverflow.com/q...
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单细胞数据处理小细节汇总1. Seurat对象查看当前的Assay 在进行了SCTransform操作后，矩阵默认会变成SCT矩阵，如果不加设置，后续的PCA等操作都是基于SCT矩阵。修改Defau...
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带对角线和显著性的相关性热图1.目的 用对角线热图来展示相关性。上三角形是相关性p值(颜色和显著性)，下三角形是相关系数，同时展示两种信息，也没有显得很杂乱。 2.搜索 记得我早先见过，但当时没感觉这图...
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利用流式细胞仪测细胞凋亡（Apoptosis） Annexin V/PI染色法利用流式细胞仪测细胞凋亡（Apoptosis） Annexin V/PI染色法 2020/06/0240392 工作原理： 正常细胞的表面由不对称分布在质膜内叶和外叶上的脂质...
