简介 cellphoneDB 是最常见的进行细胞通讯分析的工具，但是其分析所需环境较为复杂而且容易产生各类报错。目前常用的细胞通讯分析还有CellChat，一款使用更容易且可...
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细胞通讯(CellChat)高级配受体气泡图 -
【单细胞】ggplot2美化monocle2轨迹展示结果前面测试过monocle2/3，但是在画图的时候，尤其是用默认软件画图的时候总是觉得不够好看。比如下面这个paper中的数据（https://pubmed.ncbi.nlm....
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零基础学生信入门笔记(R语言、Linux、Python、RNA-seq、单细胞测序、质谱流式、TCGA、GEO、单细胞经典文献解读)
医学生零基础学生信是先学Python还是先学R语言？[https://www.zhihu.com/question/432353982]如何学习R语言[https://www...
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单细胞分群 髓系细胞的markers（持续更新）
髓系细胞的转录markers有时候互相混杂，很难分清，不同文献中使用的标记各不相同。在本文中进行记录 单核细胞起源巨噬细胞（Monocyte-derived macropha...
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单细胞测序——纠结的髓系细胞注释主要根据文献中的描述与方法 髓系细胞分类 巨噬细胞，单核细胞，DC细胞 文献一：Single-cell landscape of the ecosystem in early...
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单细胞测序——髓系细胞注释marker
主要根据文献中的描述与方法 髓系细胞分类 巨噬细胞，单核细胞，DC细胞 文献一：Single-cell landscape of the ecosystem in early...
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单细胞之轨迹分析-2：monocle2 原理解读+实操轨迹分析系列： 单细胞之轨迹分析-1：RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析（Pseudot...
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单细胞 | Pseudobulk RNA-seq阅读Integrated multi-omic characterization of congenital heart disease这篇文章的时候发现一张图（图2d、2e...
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01.infercnv-区分肿瘤样本中的正常上皮细胞-infercnv运行参考文献Therapy-Induced Evolution of Human Lung Cancer Revealed by Single-Cell RNA Sequenci...
