1、LD连锁不平衡介绍 （1）LD连锁不平衡介绍 连锁不平衡指的是在某一群体中，两个基因同时遗传的频率大于随机组合的频率。 用于衡量连锁不平衡程度的指标主要有D、D'和r2三...
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群体进化分析--基因流及群体历史分析——我愿称之为史上最全基因流（也称基因迁移）是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因，是遗传变异一个非常重要的来源，...
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10.GWAS：LD decay(LD衰减）—— PopLDdecay关于连锁不平衡的详细介绍在之前的帖子里有说过，这里就不再赘述，本篇主要介绍LD decay的计算。1.GWAS：原理与目的 - 简书 (jianshu.com)[https:...
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混合（Pooling）样本测序研究1.混合测序基础 测序成本虽然下降了，但对于植物育种应用研究来说还是很高，动不动就上百群体，小小植物个体价值又低，测完了很可能后面就用不到了。这时，混合样本测序是一种省钱的好...
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FDR 和 q-value
| 转载自G. Corey Shan 的 FDR 和 q-value 最近在做一个肝癌预测的项目，建模使用的数据源在The Cancer Genome Atlas (TCGA...
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跟着Nature Communications学作图:R语言ggplot2画世界地图并用md语法添加文字标签论文 MiDAS 4: A global catalogue of full-length 16S rRNA gene sequences and taxonomy for ...
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Perl单行（Perl One-Liners）命令
Perl语言的一大好处就是，在日常处理各种小任务时，可以利用Perl单行的各种内置变量和参数快捷实现。本文记录平时做分析时常用的perl内置变量、基本参数和一些常用命令。 个...
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跟着GlobalChangeBiology学作图:R语言ggplot2点线图(2)给分面添加注释论文 Changes in plant inputs alter soil carbon and microbial communities in forest 本地pdf ...
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【R语言】R包dplyr(一):数据转换
日常在工作中会碰到很多数据批量处理的问题，有的时候单独造轮子很费时间，这个时候我发现了dplyr这个R包，能帮助你解决数据处理中的绝大多数难题。dplyr是tidyverse...
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