• 指在非家系群体或系谱不明确的群体中两特定材料之间的遗传相似度与任意材料之间的遗传相似度的相对值; • 材料间不平衡的血缘关系是导致标记出现非连锁相关的另一个重要原因,小家...
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IP属地:福建
• 指在非家系群体或系谱不明确的群体中两特定材料之间的遗传相似度与任意材料之间的遗传相似度的相对值; • 材料间不平衡的血缘关系是导致标记出现非连锁相关的另一个重要原因,小家...
我梳理了GWAS全基因组关联分析的整个流程,并提供了基本的命令,用到的软件包括BWA、samtools、gatk、Plink、Admixture、Tassel等,在此分享出来...
更多精彩请至《KS科研分享与服务公众号》除了之前说过的三种常见单细胞基因可视化方法外,还有一种最常用的就是直接在UMAP或者TSNE降维图上显示表达某基因的细胞,这种方式更加...
一般使用 CMplot 绘制SNP密度图:包链接:https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要绘制 SNP 密度图,仅仅需要三列即可:a. 第...
NOTE 基于种群聚类,特有等位基因 基本概念 1 多态性条带 个人理解就是ssr引物1 在位点 扩增出的 a b 2个条带(2倍体),ab长度可能相同也可能不相同。如果a条...
操作前需要以下软件,且,Ubuntu已经安装在VMware Workstation上。 VMware的编辑tab->虚拟网络编辑 菜单查看网络配置: 1.进入su模式下,vi...
摘要: 本研究采用广泛靶向的代谢组学和RNA测序相结合的方法,研究了棉花体细胞胚胎发生植株的动态代谢和转录谱. 非胚性阶段愈伤组织(NEC)、原代胚胎发生细胞(PEC)和起始...
一、SNP分析内容(包括但不局限):①call SNP的软件——freebayes;②计算全部SNP数量;③平均多少核苷酸包含一个SNP;④计算全基因组转换/颠换率。 二、物...