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发简信
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从GitHub安装R包报错Error: Failed to install 'Rpackage' from GitHub: Does not appear to be an R packa...
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欢迎大家来到我们的生信星球第二十八期训练营～“公众号：生信星球” 在这里，希望你能收获知识和快乐，结识一帮志同道合的小伙伴 豆豆和花花也会尽力帮助大
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个人学习生信的一点心得 欢迎讨论指摘
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在线工具网站，生物分析的一些网站或者数据库之类的文章。🎻相关的文章会在收录时间上相近，请点击『最新收录』 🎡🎡🎡🎡🎡🎡🎡🎡🎡🎡🎡🎡🎡 🕸 数据库，比如Ensembl、Phytome 🕸 癌症分析网站，比如GEPIA、cBioportal 🕸 系统发育树的美化，比如iTOL 🕸 基因注释，比如Metascape、KASS 🕸 蛋白质结构预测，比如pfam、SMART 🕸 在线绘制统计图，比如Venny 🕸 序列比对，比如blast 🕸 引物设计，比如primer3、primer-blast 🕸 文献下载，比如sci-hub，文献鸟 🕸 。。。
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一些生物信息学用到的软件，工具，介绍用法安装以及以及应用的文章 🛠 测序组装使用的Spades、canu等等 🛠 序列比对比如blast、bowtie、diamond等 🛠 多序列比对比如mega、clustalW、matff等 🛠 序列格式转化的samtools、bedtools等等 🛠 可变剪接分析的rMATS、MISO 🛠 微卫星序列查找工具misa等 🛠 call peak的工具macs2 🛠 文献下载工具Sci-hub桌面版 🛠 进化树构建工具IQtree、ggtree等 🛠 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 🛠 寻找测序中的结构变异或者SNP序列GATK、bcftools等 🛠 宏基因组组装与分析的anvi'o、QIMME 🛠 测序质量评估的FastQC、BUSCO、QUAST 🛠 可视化工具比如IGV、3D Genome 🛠 测序数据下载工具SRA Toolkit、ascp等 🛠 数据可视化的工具circos 等等
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本小推车专门推各种perl相关的基本语法介绍，资源，应用。特别是与生物信息学应用相关的文章。 🕛🕐🕑🕒🕓🕔🕕🕖🕗🕘🕙🕚 文章的收录是有顺序的，查看的时候请点击“最新收录”然后进行查看。 🐫 perl基本语法，比如和python语法的区别 🐫 perl上下文，比如将列表赋值给标量会发生什么 🐫 perl特殊变量，比如$_ $/ $\ 🐫 perl入门，比如循环，常见的正则使用等 🐫 perl进阶，比如引用，比如map grep等 🐫 perl高级，比如命名空间，继承，闭包等 🐫 perl的单行程序，比如与linux的各个工具搭配 🐫 perl常用模块，比如File::Basename Yaml 🐫 perl绘图，比如svg模块，GD模块，circos工具等等 🐫 perl与生物信息学之间的关系，比如用perl提取genbank 🐫 perl6的相关用法（生信不太建议学perl6） 备注：本文很多的文章也可在 JSON_NULL 的专题 『码神之路：perl篇』 中找到。这个专题对我的帮助很大，感谢这位简友
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记录数据分析过程中遇到的那些让我涨知识的坑，生信札记
