一、找到Aspera软件官网地址 二、安装Aspera Connect插件 三、下载Aspera Connect 此步骤会下载一个这样的文件:ibm-aspera-conne...
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一、找到Aspera软件官网地址 二、安装Aspera Connect插件 三、下载Aspera Connect 此步骤会下载一个这样的文件:ibm-aspera-conne...
一、下载 首先要用sudo权限下载git编辑器。 这个过程有报错,可以参考我的文章:https://www.jianshu.com/p/dafa92597846[https:...
#1 安装Aspera 下载地址:https://downloads.asperasoft.com/connect2/NCBI首页也有提供下载: 到了下面这个页面,一步一步操...
上一篇文章提到Linux系统下如何下载。但是鉴于服务器网络连接受到限制的问题,所以还是先windows下载,然后再上传吧。那么,windows下怎么搞呢?1.下载window...
官方推荐使用SRATOOLKIT,那义无反顾的就用它吧 准备篇 首先:打开官网 NCBI SRA Tool Kit下载最新的SRA版本软件,有四种平台软件可选。注意自己下的版...
一、下载 地址:https://github.com/stephaneguindon/phyml[https://github.com/stephaneguindon/phy...
摘自:http://www.chenlianfu.com/?p=2221http://www.bio-info-trainee.com/tag/phyml 使用 PhyML ...
DESeq2用来处理转录组数据。那么先来完成第一步:安装。1、传统方式安装 麻蛋,报错了!!!!为什么受伤的总是我。 2、开启查阅资料模式,然后得到的结论是这个包的安装需要利...
导读 1. DDBJ数据库简介 DDBJ(DNA Data Bank of Japan)是与NCBI的GenBank,EMBL的EBI数据库齐名的世界三大DNA 数据库之一。...
一、比对原理 原文:HISAT: a fast spliced aligner with low memory requirements. 摘要 1、Hisat是一种高效的R...
如今大量物种参考基因组数据已被公布,对于科研工作者,可以说是一笔巨大“财富”。那么该如何获取这笔“财富”呢? 本期将介绍几个相关的数据库,并举例演示如何查找和下载到想要的参考...
1.背景知识 1.1什么是可变剪切 可变剪切(differential splicing)也叫做选择性剪切alternative splicing, 指的是在mRNA前体到成...
1. 在phytozome13 上面搜索下载物种基因组数据 首先登录phytozome13 (https://phytozome-next.jgi.doe.gov/),注册一...
嗨嗨,好久不见,太久没有更新啦。前几天和老师讨论实验的时候,他提到了这个数据库挺方便,之前只是听说过,没有研究过怎么用,回来之后我就仔细看了下,今天顺便记录一些基本操作哈。 ...
不时,我们手上会拿到一些进化树或聚类树文本,往往是 newick 格式,比如 其中记录了不同单元的关系远近。可视化进化树,可以让我们更直观地进行分析。可选的软件有很多,但其中...
原创:montreal生信人2018-11-19 鲸鲨,是人类已知最大的现存鱼类动物。记录到的最大尺寸为12米长,21.5吨重(数据来自维基)。分类上讲,其属于鱼总纲下面的软...
本篇文章是为了记录本人在系统发育实验和数据分析过程中,所使用过的以及部分未使用但如雷贯耳的软件的集合。当然,相对于整个系统发育软件之汪洋大海,此处不过一滴水! 1. 数据获取...
虽然简单,但绝对首发……该给自己的系统发育构建流程升级了,新版本软件不仅速度快,而且对用户友好! modeltest-ng 的速度是真的飞快!modeltest-ng 和 r...
生信软件:phyml - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/5514e1343d36]Linux中$PATH详解_虽迟但到...
1、软件的功能 CellChat主要可以做2部分工作: 1)受体-配体互作。CellChatDB包含人类和小鼠中具有文献支持的配体-受体互作关系,包括多聚体和辅酶因子; 2)...