DESeq2用来处理转录组数据。那么先来完成第一步：安装。1、传统方式安装 麻蛋，报错了！！！！为什么受伤的总是我。 2、开启查阅资料模式，然后得到的结论是这个包的安装需要利...
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R语言安装DESeq2包
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DDBJ数据库：宏转录组测序数据下载导读 1. DDBJ数据库简介 DDBJ(DNA Data Bank of Japan)是与NCBI的GenBank，EMBL的EBI数据库齐名的世界三大DNA 数据库之一。...
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Hisat2的使用说明一、比对原理 原文：HISAT: a fast spliced aligner with low memory requirements. 摘要 1、Hisat是一种高效的R...
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Ensembl和NCBI基因组下载，基因序列下载查看如今大量物种参考基因组数据已被公布，对于科研工作者，可以说是一笔巨大“财富”。那么该如何获取这笔“财富”呢？ 本期将介绍几个相关的数据库，并举例演示如何查找和下载到想要的参考...
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二代转录组可变剪切(AS)分析1.背景知识 1.1什么是可变剪切 可变剪切（differential splicing）也叫做选择性剪切alternative splicing, 指的是在mRNA前体到成...
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在phytozome13 上面搜索下载物种基因组数据，进行基因家族分析1. 在phytozome13 上面搜索下载物种基因组数据 首先登录phytozome13 （https://phytozome-next.jgi.doe.gov/），注册一...
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都2020年了，我不允许你不会用phytozome数据库嗨嗨，好久不见，太久没有更新啦。前几天和老师讨论实验的时候，他提到了这个数据库挺方便，之前只是听说过，没有研究过怎么用，回来之后我就仔细看了下，今天顺便记录一些基本操作哈。 ...
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figtree 简洁好用绘制进化树 | 生信分析常用GUI软件介绍与安装不时，我们手上会拿到一些进化树或聚类树文本，往往是 newick 格式，比如 其中记录了不同单元的关系远近。可视化进化树，可以让我们更直观地进行分析。可选的软件有很多，但其中...
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追鲨鲸魂——三篇文章共解地球上吨位最大鱼类基因组
原创：montreal生信人2018-11-19 鲸鲨，是人类已知最大的现存鱼类动物。记录到的最大尺寸为12米长，21.5吨重（数据来自维基）。分类上讲，其属于鱼总纲下面的软...
