非常实用
探针注释之其他基因id转换0.介绍一下find_anno 我搞了一个函数，名叫find_anno，可以根据GPL平台编号给出探针注释的代码 第一种情况是有两个代码可以用 例如 给出的红色字里面就有代码...
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探针注释之其他基因id转换0.介绍一下find_anno 我搞了一个函数，名叫find_anno，可以根据GPL平台编号给出探针注释的代码 第一种情况是有两个代码可以用 例如 给出的红色字里面就有代码...
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通过GSVA与相关性分析寻找目的基因的相关通路
最近帮师弟做一个GSVA分析，发现已经忘的差不多了，顺便整理一下吧。 基因集变异分析（Gene Set Variation Analysis, GSVA）可以将一个基因表达矩...
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WGCNA（3）：基因模块与性状关联识别重要基因前面的文章中完成了数据导入和网络构建，下面是将基因模块与性状进行关联，从而识别与表型相关的重要基因。WGCNA（1）：R包安装及数据导入清洗 - 简书 (jianshu.co...
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单细胞之富集分析-2：批量GSEA和GSVA分析单细胞富集分析系列： 单细胞之富集分析-1：单细胞GSEA分析流程[https://www.jianshu.com/p/00f069cb239c] 1. 背景 Gene Se...
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10X单细胞（10X空间转录组）数据分析之细胞过滤那些事hello，大家好，今天已经是五一假期的第二天，本人呢，哪也去不了，只好在家歇着，所以呢，给自己找点事做，本人93年，单身，现居天津武清，女孩子有没有想谈恋爱了，可以联系我，...
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单细胞数据中到底应该如何处理线粒体基因
什么是线粒体基因 线粒体是参与细胞凋亡启动和执行的主要细胞器之一。线粒体基因在大多数细胞中表达，其表达水平是细胞类型特异性的。也就是说这个也是和细胞类型及其状态有关系的。 为...
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非生信人员做单细胞数据分析的入门秘籍写在前面 自2009年第一篇单细胞转录组文章发表以来，经过十多年的发展，各研究机构和生物公司相继推出单细胞RNA测序(scRNA-seq)服务，这使得单细胞测序已经从“王谢堂...
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学到很多，后面是不是还有一个单细胞WGCNA（2），很期待
单细胞WGCNA分析(1)
我在前面也分享过几篇关于WGCNA的帖子，其实WGCNA本身就是对基因进行了加权共表达，合理分组的结果。 如果对于一个表达量矩阵，本身就至于2个分组，WT和处理，那么简单的差...
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单细胞WGCNA分析(1)我在前面也分享过几篇关于WGCNA的帖子，其实WGCNA本身就是对基因进行了加权共表达，合理分组的结果。 如果对于一个表达量矩阵，本身就至于2个分组，WT和处理，那么简单的差...
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单细胞测序——髓系细胞注释marker主要根据文献中的描述与方法 髓系细胞分类 巨噬细胞，单核细胞，DC细胞 文献一：Single-cell landscape of the ecosystem in early...
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免疫细胞注释-2：髓系细胞scRNAseq免疫细胞注释： 免疫细胞注释-1：T细胞[https://www.jianshu.com/p/0127c9b380c9] 免疫细胞注释-2：髓系细胞[http...
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免疫细胞注释-1：T细胞scRNAseq免疫细胞注释： 免疫细胞注释-1：T细胞[https://www.jianshu.com/p/0127c9b380c9] 免疫细胞注释-2：髓系细胞[http...
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10+SCI，生信分析筛选基因+实验验证，可以作为模板文章学习！生信小课堂 大家好！今天给大家介绍一篇2023年1月发表在International Journal of Biological Sciences（IF=10.75）杂志上，...
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