关键词：基因表达差异分析、Differential Expression Genes、设计矩阵、Design Matrix、比较矩阵、Contrast Matrix 本文参考...
IP属地：上海
-
基因表达相关分析设计矩阵指南（Ⅰ） -
CITE-seq：同时测细胞表面蛋白和RNA的单细胞测序单细胞测序方法和原理系列： 1. 单细胞转录组建库原理：SMART、TargetAmp和10X genomics[https://www.jianshu.com/p/6c5d...
-
Ubuntu2204 RStudio server网页登录显示'Error: Unauthorized user.'
检查rstudio的.log文件/var/log/rstudio/rstudio-server/rserver.log 我的问题是： Rstudio官网的介绍中，最小的use...
-
从古代婚姻到现代爱情观：演变与反思
在探讨人类情感关系的历史变迁时，我们不可避免地要触及封建社会时期以生产和繁衍为主要目的的婚姻制度以及现代社会所倡导的爱情自由观念。这两种截然不同的现象揭示了不同时代背景下的爱...
-
春河之畔，柳色青青
每年春天，景淮都会来到这条熟悉的河边，那里的柳树如诗如画，每年准时绽放出最鲜嫩的绿意。今年，他的心情格外不同，因为他知道，云筝会在这里与他相约。他们在大学时代相识，那时的云筝...
-
春日觉醒：颓废之心遇见希望之光
春天，这个万物复苏的季节，带着温暖的气息悄然而至。大地抖落了冬日的沉寂，换上了生机勃勃的新装。然而，在这充满活力的景象中，有那么一个人，他的内心却像被遗忘的角落，沉浸在颓废的...
-
infercnv Error in .single_tumor_leiden_subclustering(tumor_group = tumor_group, : lazy-load d...
出现错误： 可以尝试重启R session，重新执行命令
-
infercnv Error in `ScaleData()`: ! No layer matching pattern 'data' found. Please run NormalizeDa...
原因 我的R运行环境里，用的是Seurat v5，出现这个问题主要是Infercnv与新的Seurat对象不兼容 解决 在运行infercnv::run()之前，运行代码：
-
infercnv错误 Error in FUN(left, right) : non-numeric argument to binary operator
如果在报错前出现以下两条INFO信息： 说明基因注释文件的格式不对。 原因和解决方法 在infercnv_1.18.1及1.19.1的版本中，出现此错误的位置是which(g...
-
CentOS7和Rstudio server安装LAPACK library、JAGS、rjags 和 inferCNV
1. 安装BLAS和LAPACK library 首先非常感谢参考文章(前两步都是参考这篇文章)inferCNV centos服务器安装失败解决 - 简书 (jianshu....
-
inferCNV centos服务器安装失败解决
前言 昨天在安装inferCNV的包时频繁报错，尝试了很多方式最终解决，现将解决方法记录如下 服务器版本 CentOS Linux release 7.9.2009 (Cor...
-
R 数据可视化 —— 对角线分割热图前言 不是在帮人解决问题，就是在解决问题的路上~~~。 之前所介绍的热图，其每个颜色块都是一个矩形，而今天要介绍的是如何绘制对角线分割热图。也就是每个颜色块矩形被对角线分割为...
-
Python 在list(列表）尾部添加另一个列表的元素
在list(a)尾部添加list(b)有两种常见的方法：append() / extend() 试试这两种方法的区别：append()方法相当于把b作为一个元素添加在a的尾部...
-
jupyter-lab 设置密码(password)
jupyter-lab网页端有token和passwd两种验证登录方式，个人觉得passwd比较安全且方便一些 首先，生成jupyter-lab默认配置文件，在Termina...
-
python爬取网页内容写入文件时报错：UnicodeEncodeError: 'gbk' codec can't encode character '\xf6'
问题描述 用r = requests.get(url, params)爬取网页，新建一个文件并保存r.text时报错 意思是'gbk'编解码器不能编码Unicode字符'\x...
-
python 对DataFrame某列的部分（某些）元素赋值
首先创建一个DataFrame 来到赋值场景： 需求：需要对 rating 列的[0, 1, 4]行的3个元素赋值为[[5], [5], [4]]， 也就是同时使用位置索引（...
-
我也是来回折腾弄了大半天了。我是通过在，我的R环境里执行conda install r-xml， libxml2-devel-cos7-x86_64， libxml2 我也不记得了。最后成功了
-
Linux文本处理工具awk：从行中提取特定字段按格式输出从文本的每一行中提取特定字段并输出 以csv（逗号分隔）文件为例，文件格式如下：文件格式测试文本可点击 test.csv[https://pan.baidu.com/s/1M...
-
Ensembl 下载人类基因组注释文件
可能是网络的原因，不能访问 https://www.ensembl[https://www.ensembl]. org/ 的ftp网站 ensembl 有一个Downloa...
-
Mac OS Endnotex9 引用图标显示灰色，且Word中没有Endnote X9 插件我的方法 我的是Endnote X9 版本，直接去Endnote官网下载的Cite While You Write插件是version: 20.4.0.18004，安装后发现...