SNPs marker是全基因组范围应用广泛的分子标记,本文介绍生态基因组学中利用GATK4软件进行SNPs calling的流程(人的研究中可能略有不同)。以下所有分析过程...
我们最常用最熟悉的功能数据库之一:GO(gene onotology),基因本体论。其实是一套标准词汇术语,目的是从不同角度来描述某个基因的特点和功能,三大本体如生物学进程(...
前言 我还未想到这个专题叫什么...... 暂定“XXX就那样”? 我们先来个斗鸡眼,看着一下中间的QT。 1.什么是数量性状?(quantitative trait,QT)...
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deeptools可视化ref1:deeptools辅助CHIP-seq数据分析-可视化 | 生信菜鸟团 ref2:如何使用deeptools处理BAM数据 - 生信技能树 ref3:The too...
你好,请问你现在可视化的应该是reads在基因结构的分布情况吧,那怎么可视化call peak后的peaks在基因结构上的分布呢
今天我的个人网站提交的备案已经通过服务商提交管局审核了,静待7-20个工作日内早点通过审核获得备案号。 接触网络已有21年了,21年前的一个晚上,和师范同学带着猎奇的心理跑到...
一、什么是单倍型? 在单倍型分析前,首先需要明白什么是单倍型、什么是基因单倍型? 一般来讲,所谓的单倍型是指同一染色体上不同变异位点的各种线性组合形式。那么基因单倍型自然就是...
前言 来到这里,已经渐渐不是人话了... 估计这辈子我也没有想到,我把我最厌恶的东西写出来, 居然是最多人看的...... 分析方法很多,这一小节吐槽官网的这一行代码,大神请...
本次笔记内容:cor.test()和cor()rcorr() {Hmisc}corr.test() {psych}spearmanCI() {spearmanCI} spea...